Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G116900.1
Synonym Sb05g016910
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RI79
Pfam -
Panther DB PTHR31903 PTHR31903:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G62422 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g29810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029725
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G008300 expressed protein -
2 Sobic.002G175900 expressed protein -
3 Sobic.006G274500 plant-specific domain TIGR01627 family protein, expressed -
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6 Sobic.003G016400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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8 Sobic.001G385500 - -
9 Sobic.004G275100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.005G096000 resistance protein, putative, expressed -
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12 Sobic.004G192400 OsFBX77 - F-box domain containing protein, expressed K14495: GID2, F-box protein GID2
13 Sobic.001G136500 RNA recognition motif containing protein, expressed K12885: RBMX, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein G
14 Sobic.001G144600 parafibromin, putative, expressed K15175: parafibromin
15 Sobic.004G006700 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G194600 ZOS1-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.001G420900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ankyrin repeat family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G015000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G344000 DUF581 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G214800 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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