Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G192400.2
Synonym Sb04g024040, SLY1
Functional annotation OsFBX77 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RPA8
Pfam PF00646
Panther DB PTHR12874 PTHR12874:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14495; GID2, F-box protein GID2
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24210 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g10040.1 : OsFBX77 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031751 , Zm00025a020830
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G192400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.009G128800 expressed protein -
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20 Sobic.003G382100 PHD finger protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G192400 Sobic004G192400 Sobic004G206300 Sobic004G206300 Sobic004G192400--Sobic004G206300 Sobic009G031500 Sobic009G031500 Sobic004G192400--Sobic009G031500 Sobic003G342900 Sobic003G342900 Sobic004G192400--Sobic003G342900 Sobic004G129600 Sobic004G129600 Sobic004G192400--Sobic004G129600 Sobic006G126600 Sobic006G126600 Sobic004G192400--Sobic006G126600 Sobic004G027000 Sobic004G027000 Sobic004G192400--Sobic004G027000 Sobic009G083600 Sobic009G083600 Sobic004G192400--Sobic009G083600 Sobic006G162600 Sobic006G162600 Sobic004G192400--Sobic006G162600 Sobic001G382400 Sobic001G382400 Sobic004G192400--Sobic001G382400 Sobic004G212700 Sobic004G212700 Sobic004G206300--Sobic004G212700 Sobic004G206300--Sobic004G027000 Sobic009G056300 Sobic009G056300 Sobic004G206300--Sobic009G056300 Sobic004G206300--Sobic004G129600 Sobic004G206300--Sobic009G031500 Sobic008G125000 Sobic008G125000 Sobic004G206300--Sobic008G125000 Sobic004G225300 Sobic004G225300 Sobic004G206300--Sobic004G225300 Sobic001G335500 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Octagon: transcription factors


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