Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G160500.1
Synonym CCR2, Sb05g022240, CRTISO
Functional annotation amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed
UniProt C5Y4W1
Pfam PF01593
Panther DB PTHR10668 PTHR10668:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology K09835; crtISO, prolycopene isomerase
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06820 : carotenoid isomerase
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g36440.1 : amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033849 , Zm00025a015788
Brachypodium KQJ88146 , KQK22479
Barley HORVU1Hr1G015490.2 , HORVU1Hr1G015490.6 , HORVU1Hr1G015490.7 , HORVU1Hr1G015490.4 , HORVU1Hr1G015490.5
Wheat TraesCS1D02G074300 , TraesCS1A02G071700 , TraesCS1B02G090300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G160500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic005G160500 Sobic005G160500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic005G160500--Sobic002G207601 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic005G160500--Sobic006G136300 Sobic009G144400 Sobic009G144400 Sobic005G160500--Sobic009G144400 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic005G160500--Sobic006G221500 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic005G160500--Sobic006G213350 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic005G160500--Sobic005G031400 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic005G160500--Sobic003G162600 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic005G160500--Sobic001G150100 Sobic001G139800 Sobic001G139800 Sobic005G160500--Sobic001G139800 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic002G207601--Sobic004G257900 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G207601--Sobic001G489400 Sobic002G207601--Sobic006G213350 Sobic002G197500 Sobic002G197500 Sobic002G207601--Sobic002G197500 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic002G207601--Sobic001G156401 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic002G207601--Sobic008G143901 Sobic002G207601--Sobic001G139800 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G207601--Sobic009G199401 Sobic002G207601--Sobic005G160500 Sobic006G136300--Sobic006G221500 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic006G136300--Sobic001G052700 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic006G136300--Sobic004G315400 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic006G136300--Sobic004G267400 Sobic006G136300--Sobic005G031400 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic006G136300--Sobic002G374000 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic006G136300--Sobic006G235801 Sobic006G136300--Sobic006G213350 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G136300--Sobic009G173700 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic009G144400--Sobic008G169500 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic009G144400--Sobic003G230800 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic009G144400--Sobic002G226200 Sobic009G144400--Sobic001G150100 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic009G144400--Sobic006G215650 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic009G144400--Sobic002G208500 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic009G144400--Sobic008G190600 Sobic009G144400--Sobic001G139800 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic009G144400--Sobic002G129900 Sobic006G221500--Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic009G173700 Sobic006G221500--Sobic006G235801 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic004G267400 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic003G162600 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic006G221500--Sobic008G142500 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic006G213350--Sobic001G520000 Sobic006G213350--Sobic005G031400 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic006G213350--Sobic001G483001 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic006G213350--Sobic008G160100 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic006G213350--Sobic010G012200 Sobic006G213350--Sobic008G143901 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic006G213350--Sobic003G253700 Sobic006G243000 Sobic006G243000 Sobic006G213350--Sobic006G243000 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic006G213350--Sobic006G157450 Sobic005G031400--Sobic008G190600 Sobic005G031400--Sobic006G213350 Sobic005G031400--Sobic001G483001 Sobic005G031400--Sobic010G012200 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic005G031400--Sobic008G142200 Sobic005G031400--Sobic006G157450 Sobic005G031400--Sobic001G520000 Sobic005G031400--Sobic004G315400 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic005G031400--Sobic008G170800 Sobic003G162600--Sobic001G489400 Sobic003G162600--Sobic009G199401 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic004G186950 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic003G162600--Sobic005G116700 Sobic003G162600--Sobic006G221500 Sobic003G162600--Sobic001G150100 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic003G162600--Sobic002G421100 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G162600--Sobic005G187700 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic003G162600--Sobic001G014600 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic001G150100--Sobic002G380150 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G150100--Sobic006G279100 Sobic001G150100--Sobic003G162600 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic001G150100--Sobic007G206400 Sobic001G150100--Sobic009G144400 Sobic001G150100--Sobic006G215650 Sobic001G150100--Sobic001G483001 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic001G150100--Sobic002G208900 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic001G150100--Sobic009G199750 Sobic001G139800--Sobic008G143901 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic001G139800--Sobic006G021100 Sobic001G139800--Sobic006G213350 Sobic001G139800--Sobic001G483001 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic001G139800--Sobic002G413700 Sobic001G139800--Sobic006G243000 Sobic001G139800--Sobic001G156401 Sobic001G139800--Sobic008G190600 Sobic001G139800--Sobic009G144400
Octagon: transcription factors


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