Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G078000.1
Synonym Sb06g016490
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RD97
Pfam -
Panther DB PTHR34662 PTHR34662:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g33790.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011445
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G330400 - -
2 Sobic.001G197600 - -
3 Sobic.004G001800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
4 Sobic.004G074100 expressed protein -
5 Sobic.006G185000 expressed protein -
6 Sobic.003G186132 - -
7 Sobic.004G191800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
8 Sobic.008G026600 BTBN6 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
9 Sobic.001G507800 OsSub26 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
10 Sobic.010G246300 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G016600 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
12 Sobic.008G077100 - -
13 Sobic.006G278300 thaumatin, putative, expressed -
14 Sobic.009G135400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G267100 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed K13946: AUX1, auxin influx carrier (AUX1 LAX family)
16 Sobic.001G276800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
17 Sobic.007G111700 glutathione S-transferase, C-terminal domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G164700 expressed protein -
19 Sobic.002G278200 thaumatin, putative, expressed -
20 Sobic.006G278000 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G078000 Sobic006G078000 Sobic003G330400 Sobic003G330400 Sobic006G078000--Sobic003G330400 Sobic001G197600 Sobic001G197600 Sobic006G078000--Sobic001G197600 Sobic004G001800 Sobic004G001800 Sobic006G078000--Sobic004G001800 Sobic004G074100 Sobic004G074100 Sobic006G078000--Sobic004G074100 Sobic006G185000 Sobic006G185000 Sobic006G078000--Sobic006G185000 Sobic003G186132 Sobic003G186132 Sobic006G078000--Sobic003G186132 Sobic004G191800 Sobic004G191800 Sobic006G078000--Sobic004G191800 Sobic008G026600 Sobic008G026600 Sobic006G078000--Sobic008G026600 Sobic001G507800 Sobic001G507800 Sobic006G078000--Sobic001G507800 Sobic003G330400--Sobic006G078000 Sobic003G330400--Sobic008G026600 Sobic003G330400--Sobic004G074100 Sobic005G119300 Sobic005G119300 Sobic003G330400--Sobic005G119300 Sobic009G135400 Sobic009G135400 Sobic003G330400--Sobic009G135400 Sobic006G082800 Sobic006G082800 Sobic003G330400--Sobic006G082800 Sobic009G149000 Sobic009G149000 Sobic003G330400--Sobic009G149000 Sobic002G293400 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Octagon: transcription factors


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