Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G186132.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXY7
Pfam -
Panther DB PTHR10460 PTHR10460:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G49290 : ABL interactor-like protein 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g37110.1 : ABIL2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028800
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7B02G245700 , TraesCS7B02G245700 , TraesCS1A02G056100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G159400 patatin, putative, expressed -
2 Sobic.006G185000 expressed protein -
3 Sobic.006G009800 - -
4 Sobic.001G506500 exostosin family domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G308200 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
6 Sobic.007G115600 protein kinase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G091500 OsMADS26 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
8 Sobic.004G091500 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
9 Sobic.002G372100 nodulation-signaling pathway 1 protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G278300 thaumatin, putative, expressed -
11 Sobic.003G235900 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
12 Sobic.008G123400 HEAT repeat family protein, putative, expressed K11491: condensin-2 complex subunit D3
13 Sobic.010G261200 LTPL86 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
14 Sobic.006G078000 expressed protein -
15 Sobic.003G331900 - -
16 Sobic.010G083300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
17 Sobic.001G385200 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G176100 expressed protein -
19 Sobic.010G019600 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
20 Sobic.010G082100 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic003G186132 Sobic003G186132 Sobic005G159400 Sobic005G159400 Sobic003G186132--Sobic005G159400 Sobic006G185000 Sobic006G185000 Sobic003G186132--Sobic006G185000 Sobic006G009800 Sobic006G009800 Sobic003G186132--Sobic006G009800 Sobic001G506500 Sobic001G506500 Sobic003G186132--Sobic001G506500 Sobic002G308200 Sobic002G308200 Sobic003G186132--Sobic002G308200 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic003G186132--Sobic007G115600 Sobic006G091500 Sobic006G091500 Sobic003G186132--Sobic006G091500 Sobic004G091500 Sobic004G091500 Sobic003G186132--Sobic004G091500 Sobic002G372100 Sobic002G372100 Sobic003G186132--Sobic002G372100 Sobic005G159400--Sobic002G372100 Sobic004G209450 Sobic004G209450 Sobic005G159400--Sobic004G209450 Sobic008G161900 Sobic008G161900 Sobic005G159400--Sobic008G161900 Sobic003G089500 Sobic003G089500 Sobic005G159400--Sobic003G089500 Sobic009G126200 Sobic009G126200 Sobic005G159400--Sobic009G126200 Sobic001G309666 Sobic001G309666 Sobic005G159400--Sobic001G309666 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Sobic002G372100--Sobic003G089500 Sobic002G372100--Sobic002G172300 Sobic005G228250 Sobic005G228250 Sobic002G372100--Sobic005G228250 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic002G372100--Sobic003G229900 Sobic001G242400 Sobic001G242400 Sobic002G372100--Sobic001G242400
Octagon: transcription factors


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