Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G110600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PLE7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G271900 EAP30/Vps36 family domain containing protein, expressed K12188: SNF8, ESCRT-II complex subunit VPS22
2 Sobic.001G212701 - -
3 Sobic.003G313700 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
4 Sobic.010G132300 CDK5RAP3, putative, expressed -
5 Sobic.002G326200 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
6 Sobic.006G229600 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
7 Sobic.004G314750 - -
8 Sobic.002G133600 - -
9 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
10 Sobic.010G155901 - -
11 Sobic.002G114600 - -
12 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
13 Sobic.003G101600 - -
14 Sobic.004G236500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
15 Sobic.003G008850 - -
16 Sobic.009G004300 ECT protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G257300 serine esterase, putative, expressed K15889: prenylcysteine alpha-carboxyl methylesterase
18 Sobic.006G058300 expressed protein -
19 Sobic.008G164525 - -
20 Sobic.004G152501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G110600 Sobic006G110600 Sobic002G271900 Sobic002G271900 Sobic006G110600--Sobic002G271900 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic006G110600--Sobic001G212701 Sobic003G313700 Sobic003G313700 Sobic006G110600--Sobic003G313700 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic006G110600--Sobic010G132300 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic006G110600--Sobic002G326200 Sobic006G229600 Sobic006G229600 Sobic006G110600--Sobic006G229600 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic006G110600--Sobic004G314750 Sobic002G133600 Sobic002G133600 Sobic006G110600--Sobic002G133600 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic006G110600--Sobic007G174100 Sobic002G271900--Sobic006G229600 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic002G271900--Sobic009G004300 Sobic002G271900--Sobic002G326200 Sobic002G271900--Sobic002G133600 Sobic002G271900--Sobic006G110600 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic002G271900--Sobic006G058300 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic002G271900--Sobic004G012100 Sobic010G155901 Sobic010G155901 Sobic002G271900--Sobic010G155901 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic002G271900--Sobic009G258150 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic007G157200 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic001G212701--Sobic002G114600 Sobic001G212701--Sobic010G132300 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G212701--Sobic004G184500 Sobic001G212701--Sobic004G314750 Sobic001G212701--Sobic007G174100 Sobic001G212701--Sobic002G326200 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic001G212701--Sobic001G176800 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G212701--Sobic005G094500 Sobic003G313700--Sobic004G314750 Sobic003G313700--Sobic002G326200 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic003G313700--Sobic001G434450 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G313700--Sobic008G164525 Sobic003G313700--Sobic001G212701 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic003G313700--Sobic003G101600 Sobic003G313700--Sobic006G110600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic003G313700--Sobic003G008850 Sobic003G313700--Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic007G174100 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic010G132300--Sobic004G160950 Sobic010G132300--Sobic010G155901 Sobic010G132300--Sobic001G212701 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic010G132300--Sobic005G076100 Sobic010G132300--Sobic002G114600 Sobic010G132300--Sobic003G008850 Sobic002G373200 Sobic002G373200 Sobic010G132300--Sobic002G373200 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic010G132300--Sobic002G165401 Sobic002G326200--Sobic007G174100 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic005G076100 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic002G326200--Sobic003G149900 Sobic002G326200--Sobic006G058300 Sobic002G326200--Sobic003G008850 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic002G326200--Sobic010G257300 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic002G326200--Sobic001G115900 Sobic002G326200--Sobic009G258150 Sobic006G229600--Sobic002G271900 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic006G229600--Sobic006G069050 Sobic006G229600--Sobic009G258150 Sobic006G229600--Sobic004G012100 Sobic004G152501 Sobic004G152501 Sobic006G229600--Sobic004G152501 Sobic006G229600--Sobic006G058300 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic006G229600--Sobic003G126400 Sobic006G229600--Sobic002G133600 Sobic006G229600--Sobic010G257300 Sobic004G314750--Sobic008G164525 Sobic004G314750--Sobic001G434450 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic004G314750--Sobic006G094400 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic004G314750--Sobic006G256801 Sobic004G314750--Sobic002G114600 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic004G314750--Sobic010G244701 Sobic004G314750--Sobic003G008850 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic004G314750--Sobic009G094000 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic004G314750--Sobic006G222800 Sobic002G133600--Sobic003G101600 Sobic002G133600--Sobic002G271900 Sobic002G133600--Sobic004G314750 Sobic002G133600--Sobic006G229600 Sobic002G133600--Sobic004G152501 Sobic002G133600--Sobic003G313700 Sobic006G257500 Sobic006G257500 Sobic002G133600--Sobic006G257500 Sobic002G133600--Sobic009G004300 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G133600--Sobic008G166250 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic003G008850
Octagon: transcription factors


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