Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G175200.1,Sobic.006G175200.2
Synonym ATMYC-2, EGL3, EGL1, Sb06g025020
Functional annotation anthocyanin regulatory Lc protein, putative, expressed
UniProt Q41285 , Q6JAH4 , C5YDL1 , A0A1Z5REJ0
Pfam PF14215 PF00010 PF00010 PF14215
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G63650 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g47080.1 : anthocyanin regulatory Lc protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010250 , Zm00025a056836
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.007G162200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G175200 Sobic006G175200 Sobic007G090466 Sobic007G090466 Sobic006G175200--Sobic007G090466 Sobic003G051900 Sobic003G051900 Sobic006G175200--Sobic003G051900 Sobic002G394000 Sobic002G394000 Sobic006G175200--Sobic002G394000 Sobic003G399166 Sobic003G399166 Sobic006G175200--Sobic003G399166 Sobic002G429900 Sobic002G429900 Sobic006G175200--Sobic002G429900 Sobic001G377050 Sobic001G377050 Sobic006G175200--Sobic001G377050 Sobic001G508000 Sobic001G508000 Sobic006G175200--Sobic001G508000 Sobic004G214500 Sobic004G214500 Sobic006G175200--Sobic004G214500 Sobic010G239033 Sobic010G239033 Sobic006G175200--Sobic010G239033 Sobic007G090466--Sobic002G394000 Sobic007G090466--Sobic001G377050 Sobic007G090466--Sobic002G429900 Sobic007G090466--Sobic004G214500 Sobic002G010150 Sobic002G010150 Sobic007G090466--Sobic002G010150 Sobic002G007400 Sobic002G007400 Sobic007G090466--Sobic002G007400 Sobic003G261700 Sobic003G261700 Sobic007G090466--Sobic003G261700 Sobic010G183700 Sobic010G183700 Sobic007G090466--Sobic010G183700 Sobic004G289200 Sobic004G289200 Sobic007G090466--Sobic004G289200 Sobic003G141550 Sobic003G141550 Sobic003G051900--Sobic003G141550 Sobic003G046900 Sobic003G046900 Sobic003G051900--Sobic003G046900 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic003G051900--Sobic001G452400 Sobic005G082950 Sobic005G082950 Sobic003G051900--Sobic005G082950 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic003G051900--Sobic002G380750 Sobic003G058400 Sobic003G058400 Sobic003G051900--Sobic003G058400 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic003G051900--Sobic005G156800 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic003G051900--Sobic008G192200 Sobic004G196000 Sobic004G196000 Sobic003G051900--Sobic004G196000 Sobic002G394000--Sobic001G377050 Sobic002G394000--Sobic007G090466 Sobic002G394000--Sobic002G429900 Sobic002G394000--Sobic004G214500 Sobic002G394000--Sobic002G007400 Sobic002G394000--Sobic002G010150 Sobic002G394000--Sobic004G289200 Sobic007G078200 Sobic007G078200 Sobic002G394000--Sobic007G078200 Sobic001G116300 Sobic001G116300 Sobic002G394000--Sobic001G116300 Sobic005G163450 Sobic005G163450 Sobic003G399166--Sobic005G163450 Sobic001G307450 Sobic001G307450 Sobic003G399166--Sobic001G307450 Sobic003G399166--Sobic005G156800 Sobic003G399166--Sobic002G380750 Sobic007G120100 Sobic007G120100 Sobic003G399166--Sobic007G120100 Sobic003G063600 Sobic003G063600 Sobic003G399166--Sobic003G063600 Sobic003G399166--Sobic001G452400 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic003G399166--Sobic003G291050 Sobic003G303000 Sobic003G303000 Sobic003G399166--Sobic003G303000 Sobic002G429900--Sobic002G394000 Sobic002G429900--Sobic007G090466 Sobic002G429900--Sobic001G377050 Sobic002G429900--Sobic010G183700 Sobic002G429900--Sobic004G214500 Sobic002G429900--Sobic007G078200 Sobic002G429900--Sobic002G010150 Sobic002G429900--Sobic002G007400 Sobic002G429900--Sobic003G261700 Sobic001G377050--Sobic002G394000 Sobic001G377050--Sobic007G090466 Sobic001G377050--Sobic002G007400 Sobic001G377050--Sobic002G429900 Sobic001G377050--Sobic004G214500 Sobic001G377050--Sobic002G010150 Sobic001G377050--Sobic004G289200 Sobic001G266500 Sobic001G266500 Sobic001G377050--Sobic001G266500 Sobic001G377050--Sobic001G116300 Sobic003G177500 Sobic003G177500 Sobic001G508000--Sobic003G177500 Sobic001G508000--Sobic003G399166 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic001G508000--Sobic001G192750 Sobic001G508000--Sobic005G163450 Sobic001G508000--Sobic005G156800 Sobic001G508000--Sobic002G380750 Sobic001G508000--Sobic003G291050 Sobic010G158601 Sobic010G158601 Sobic001G508000--Sobic010G158601 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic001G508000--Sobic009G066850 Sobic004G214500--Sobic002G394000 Sobic004G214500--Sobic001G377050 Sobic004G214500--Sobic007G090466 Sobic004G214500--Sobic002G010150 Sobic004G214500--Sobic002G429900 Sobic004G214500--Sobic002G007400 Sobic002G394700 Sobic002G394700 Sobic004G214500--Sobic002G394700 Sobic004G214500--Sobic007G078200 Sobic010G108200 Sobic010G108200 Sobic004G214500--Sobic010G108200 Sobic010G195800 Sobic010G195800 Sobic010G239033--Sobic010G195800 Sobic007G162200 Sobic007G162200 Sobic010G239033--Sobic007G162200 Sobic001G266600 Sobic001G266600 Sobic010G239033--Sobic001G266600 Sobic005G110538 Sobic005G110538 Sobic010G239033--Sobic005G110538 Sobic009G048600 Sobic009G048600 Sobic010G239033--Sobic009G048600 Sobic008G087300 Sobic008G087300 Sobic010G239033--Sobic008G087300 Sobic004G167000 Sobic004G167000 Sobic010G239033--Sobic004G167000 Sobic008G008200 Sobic008G008200 Sobic010G239033--Sobic008G008200 Sobic005G006000 Sobic005G006000 Sobic010G239033--Sobic005G006000
Octagon: transcription factors


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