Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G203800.2,Sobic.006G203800.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PN01
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g51260.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056946
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G044800 drought-induced protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.003G017900 expressed protein -
3 Sobic.005G185750 - -
4 Sobic.002G029000 protein kinase, putative, expressed -
5 Sobic.007G166500 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.003G434100 - -
7 Sobic.007G146300 pectinesterase, putative, expressed -
8 Sobic.005G181500 expressed protein -
9 Sobic.004G041800 expressed protein -
10 Sobic.002G323200 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
11 Sobic.005G209300 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G513400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
13 Sobic.004G080000 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
14 Sobic.001G024250 - -
15 Sobic.008G168932 - -
16 Sobic.007G133100 - -
17 Sobic.001G445400 expressed protein -
18 Sobic.009G072600 expressed protein -
19 Sobic.005G023600 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
20 Sobic.010G276200 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein


Gene co-expression network
sample Sobic006G203800 Sobic006G203800 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic006G203800--Sobic006G044800 Sobic003G017900 Sobic003G017900 Sobic006G203800--Sobic003G017900 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic006G203800--Sobic005G185750 Sobic002G029000 Sobic002G029000 Sobic006G203800--Sobic002G029000 Sobic007G166500 Sobic007G166500 Sobic006G203800--Sobic007G166500 Sobic003G434100 Sobic003G434100 Sobic006G203800--Sobic003G434100 Sobic007G146300 Sobic007G146300 Sobic006G203800--Sobic007G146300 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic006G203800--Sobic005G181500 Sobic004G041800 Sobic004G041800 Sobic006G203800--Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic005G185750 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic006G044800--Sobic005G209300 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic006G044800--Sobic001G202900 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic006G044800--Sobic004G289900 Sobic006G044800--Sobic005G181500 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic006G044800--Sobic001G513400 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic006G044800--Sobic008G168932 Sobic001G466100 Sobic001G466100 Sobic006G044800--Sobic001G466100 Sobic003G017900--Sobic006G044800 Sobic003G017900--Sobic005G185750 Sobic003G017900--Sobic001G513400 Sobic003G017900--Sobic008G168932 Sobic003G017900--Sobic004G289900 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic003G017900--Sobic002G405300 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic003G017900--Sobic004G287200 Sobic003G017900--Sobic005G181500 Sobic003G017900--Sobic004G041800 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic002G029000--Sobic007G166500 Sobic002G029000--Sobic003G434100 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic002G029000--Sobic002G323200 Sobic002G029000--Sobic007G146300 Sobic001G024250 Sobic001G024250 Sobic002G029000--Sobic001G024250 Sobic002G029000--Sobic005G209300 Sobic004G080000 Sobic004G080000 Sobic002G029000--Sobic004G080000 Sobic002G029000--Sobic004G041800 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic002G029000--Sobic009G072600 Sobic007G166500--Sobic002G029000 Sobic007G166500--Sobic003G434100 Sobic001G445400 Sobic001G445400 Sobic007G166500--Sobic001G445400 Sobic001G152800 Sobic001G152800 Sobic007G166500--Sobic001G152800 Sobic007G166500--Sobic007G146300 Sobic007G166500--Sobic002G323200 Sobic007G166500--Sobic001G024250 Sobic007G166500--Sobic004G080000 Sobic007G166500--Sobic005G209300 Sobic003G434100--Sobic007G166500 Sobic003G434100--Sobic002G029000 Sobic003G434100--Sobic002G323200 Sobic003G434100--Sobic009G072600 Sobic003G434100--Sobic007G146300 Sobic003G434100--Sobic001G024250 Sobic003G434100--Sobic001G445400 Sobic003G434100--Sobic005G209300 Sobic003G434100--Sobic001G152800 Sobic007G146300--Sobic004G080000 Sobic007G146300--Sobic004G041800 Sobic010G276200 Sobic010G276200 Sobic007G146300--Sobic010G276200 Sobic005G023600 Sobic005G023600 Sobic007G146300--Sobic005G023600 Sobic007G146300--Sobic005G209300 Sobic007G146300--Sobic001G466100 Sobic007G146300--Sobic001G024250 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic007G146300--Sobic010G176400 Sobic006G105500 Sobic006G105500 Sobic007G146300--Sobic006G105500 Sobic009G167201 Sobic009G167201 Sobic005G181500--Sobic009G167201 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic005G181500--Sobic009G166000 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic005G181500--Sobic004G331500 Sobic005G181500--Sobic006G044800 Sobic005G181500--Sobic001G202900 Sobic005G181500--Sobic005G209300 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G181500--Sobic010G034200 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic005G181500--Sobic005G192000 Sobic005G181500--Sobic004G287200 Sobic004G041800--Sobic004G080000 Sobic004G041800--Sobic001G466100 Sobic004G041800--Sobic007G146300 Sobic004G041800--Sobic010G276200 Sobic004G041800--Sobic005G209300 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic004G041800--Sobic010G034300 Sobic004G041800--Sobic010G176400 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic004G041800--Sobic009G252000 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic004G041800--Sobic009G091000
Octagon: transcription factors


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