Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G272400.1
Synonym ATHAP5B, HAP5B, Nuclear Factor Y, NF-YC2, SbNF-YC7, Sb06g033380
Functional annotation tentative name (PubMedID : 31536532)
core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed
UniProt C5YAN6
Pfam PF00808
Panther DB PTHR10252 PTHR10252:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G56170 : nuclear factor Y, subunit C2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g58680.1 : core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057413 , Zm00025a039429
Brachypodium PNT62182
Barley HORVU1Hr1G081010.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic006G272400--Sobic001G202900 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic006G272400--Sobic009G165900 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic006G272400--Sobic004G158100 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic006G272400--Sobic001G222800 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic006G272400--Sobic008G075800 Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic006G272400--Sobic003G286000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic006G272400--Sobic004G336401 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic006G272400--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic006G272400--Sobic002G145400 Sobic001G202900--Sobic009G165900 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic001G202900--Sobic004G331500 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic001G202900--Sobic010G034300 Sobic001G202900--Sobic004G336401 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic001G202900--Sobic010G254100 Sobic001G202900--Sobic008G097800 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic001G202900--Sobic009G166000 Sobic001G202900--Sobic008G075800 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic001G202900--Sobic004G287200 Sobic009G165900--Sobic004G331500 Sobic009G165900--Sobic004G336401 Sobic009G165900--Sobic010G254100 Sobic009G165900--Sobic008G075800 Sobic009G165900--Sobic001G202900 Sobic009G165900--Sobic009G166000 Sobic009G165900--Sobic008G097800 Sobic009G165900--Sobic010G034300 Sobic009G165900--Sobic004G287200 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic001G222800--Sobic008G075800 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G222800--Sobic007G061800 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic001G222800--Sobic010G118800 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic001G222800--Sobic010G177600 Sobic001G222800--Sobic004G287200 Sobic001G222800--Sobic007G222700 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic001G222800--Sobic001G364700 Sobic001G222800--Sobic004G331500 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic001G222800--Sobic006G234400 Sobic008G075800--Sobic007G061800 Sobic008G075800--Sobic001G222800 Sobic008G075800--Sobic010G118800 Sobic008G075800--Sobic010G177600 Sobic008G075800--Sobic004G331500 Sobic008G075800--Sobic009G166000 Sobic008G075800--Sobic004G287200 Sobic008G075800--Sobic007G222700 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic008G075800--Sobic010G034200 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G286000--Sobic004G024800 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G286000--Sobic001G539880 Sobic003G286000--Sobic007G148233 Sobic003G286000--Sobic003G195400 Sobic003G286000--Sobic004G158100 Sobic003G286000--Sobic002G225800 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic003G286000--Sobic005G035250 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic003G286000--Sobic008G011901 Sobic003G286000--Sobic001G364700 Sobic004G336401--Sobic010G254100 Sobic004G336401--Sobic008G097800 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G336401--Sobic005G035200 Sobic004G336401--Sobic002G145400 Sobic004G336401--Sobic010G034300 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic004G336401--Sobic007G221932 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic004G336401--Sobic009G252000 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic004G336401--Sobic009G091000 Sobic004G336401--Sobic004G024800 Sobic008G097800--Sobic007G221932 Sobic008G097800--Sobic004G336401 Sobic008G097800--Sobic009G091000 Sobic008G097800--Sobic009G252000 Sobic008G097800--Sobic010G254100 Sobic008G097800--Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic005G035200 Sobic008G097800--Sobic002G145400 Sobic008G097800--Sobic004G024800 Sobic002G145400--Sobic005G035200 Sobic002G145400--Sobic008G097800 Sobic002G145400--Sobic004G336401 Sobic002G145400--Sobic007G221932 Sobic002G145400--Sobic004G024800 Sobic002G145400--Sobic010G254100 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic002G145400--Sobic007G080100 Sobic002G145400--Sobic009G091000 Sobic002G145400--Sobic003G195400
Octagon: transcription factors


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