Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G086900.2,Sobic.007G086900.1,Sobic.007G086900.4,Sobic.007G086900.3
Synonym Sb07g007520
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5YJF4
Pfam PF13639
Panther DB PTHR22937 PTHR22937:SF44
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10650 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14320.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054980
Brachypodium PNT66942 , PNT66941 , KQJ95728 , KQJ95727
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G042800 - -
2 Sobic.006G143900 transporter family protein, putative, expressed K08150: SLC2A13, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (myo-inositol transporter), member 13
3 Sobic.004G295050 - -
4 Sobic.004G134000 - -
5 Sobic.003G333100 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G176900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
7 Sobic.004G099200 kinesin motor domain containing protein, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
8 Sobic.009G158400 - -
9 Sobic.006G259100 EH domain-containing protein 1, putative, expressed K12483: EH domain-containing protein 1
10 Sobic.001G135950 - -
11 Sobic.008G074100 - -
12 Sobic.003G073540 - -
13 Sobic.001G525600 fringe-related protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G071900 expressed protein -
15 Sobic.006G215500 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G021500 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G030300 - -
18 Sobic.005G145400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G057600 - -
20 Sobic.008G056700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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