Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G194200.1
Synonym Sb07g026280
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YHS8
Pfam -
Panther DB PTHR15663 PTHR15663:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g41840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005258
Brachypodium PNT68488 , KQJ99110
Barley HORVU7Hr1G054070.1 , HORVU7Hr1G054070.3 , HORVU7Hr1G054070.2 , HORVU7Hr1G054070.5 , HORVU7Hr1G054070.4 , HORVU7Hr1G054070.7 , HORVU7Hr1G054070.6
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G100500 RNA polymerase subunit, putative, expressed K03020: RPC19, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2
2 Sobic.006G108500 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G107800 expressed protein -
4 Sobic.010G224100 expressed protein -
5 Sobic.004G353650 - -
6 Sobic.006G249900 MBTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
7 Sobic.004G268600 nodulin, putative, expressed -
8 Sobic.001G128000 expressed protein -
9 Sobic.006G109200 expressed protein -
10 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G450400 cyclin, putative, expressed -
12 Sobic.003G409500 - -
13 Sobic.002G139700 tubulin binding cofactor C, putative, expressed -
14 Sobic.004G157050 - -
15 Sobic.002G180732 - -
16 Sobic.010G267300 thaumatin, putative, expressed -
17 Sobic.003G055400 expressed protein -
18 Sobic.003G160433 - -
19 Sobic.003G249500 expressed protein -
20 Sobic.003G350200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G194200 Sobic007G194200 Sobic005G100500 Sobic005G100500 Sobic007G194200--Sobic005G100500 Sobic006G108500 Sobic006G108500 Sobic007G194200--Sobic006G108500 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic007G194200--Sobic007G107800 Sobic010G224100 Sobic010G224100 Sobic007G194200--Sobic010G224100 Sobic004G353650 Sobic004G353650 Sobic007G194200--Sobic004G353650 Sobic006G249900 Sobic006G249900 Sobic007G194200--Sobic006G249900 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic007G194200--Sobic004G268600 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic007G194200--Sobic001G128000 Sobic006G109200 Sobic006G109200 Sobic007G194200--Sobic006G109200 Sobic005G100500--Sobic006G108500 Sobic003G409500 Sobic003G409500 Sobic005G100500--Sobic003G409500 Sobic005G100500--Sobic007G107800 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic005G100500--Sobic010G267300 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic005G100500--Sobic001G395600 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic005G100500--Sobic009G218700 Sobic004G015600 Sobic004G015600 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Sobic006G141100 Sobic006G109200--Sobic006G141100 Sobic009G102200 Sobic009G102200 Sobic006G109200--Sobic009G102200
Octagon: transcription factors


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