Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G109200.1
Synonym Sb06g019170
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y9X1
Pfam PF12776
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G24960 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g38960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056231
Brachypodium KQJ83007 , KQJ83006
Barley -
Wheat TraesCS2D02G326500 , TraesCS2D02G326500 , TraesCS2B02G345500 , TraesCS2B02G345500 , TraesCS2A02G336400 , TraesCS2A02G336400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G102200 expressed protein -
2 Sobic.006G095100 ORG4, putative, expressed -
3 Sobic.007G194200 expressed protein -
4 Sobic.007G130500 cation efflux family protein, putative, expressed K14692: SLC30A5_7, ZNT5_7, MTP, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 5/7
5 Sobic.003G124000 DNA methyltransferase protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
7 Sobic.001G041900 phospholipase, patatin family, putative, expressed K14674: TAG lipase / steryl ester hydrolase / phospholipase A2 / LPA acyltransferase
8 Sobic.006G141100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G102200 OsMADS75 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
10 Sobic.009G051500 expressed protein -
11 Sobic.002G139700 tubulin binding cofactor C, putative, expressed -
12 Sobic.003G030500 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
13 Sobic.009G050600 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G037000 agenet domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G077600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K10140: DNA damage-binding protein 2
16 Sobic.010G026850 - -
17 Sobic.008G124766 - -
18 Sobic.009G152800 transporter family protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G049800 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
20 Sobic.010G002301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G109200 Sobic006G109200 Sobic001G102200 Sobic001G102200 Sobic006G109200--Sobic001G102200 Sobic006G095100 Sobic006G095100 Sobic006G109200--Sobic006G095100 Sobic007G194200 Sobic007G194200 Sobic006G109200--Sobic007G194200 Sobic007G130500 Sobic007G130500 Sobic006G109200--Sobic007G130500 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic006G109200--Sobic003G124000 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic006G109200--Sobic001G408500 Sobic001G041900 Sobic001G041900 Sobic006G109200--Sobic001G041900 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic006G109200--Sobic006G141100 Sobic009G102200 Sobic009G102200 Sobic006G109200--Sobic009G102200 Sobic001G102200--Sobic007G130500 Sobic006G004200 Sobic006G004200 Sobic001G102200--Sobic006G004200 Sobic001G411500 Sobic001G411500 Sobic001G102200--Sobic001G411500 Sobic010G026850 Sobic010G026850 Sobic001G102200--Sobic010G026850 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic001G102200--Sobic005G028500 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic001G102200--Sobic006G206600 Sobic003G271100 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Octagon: transcription factors


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