Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G224100.1,Sobic.010G224100.2
Synonym Sb10g026920
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YLW9 , C5Z7R0
Pfam -
Panther DB PTHR33318 PTHR33318:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06660 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041952
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G107600.5 , HORVU7Hr1G107600.4 , HORVU7Hr1G107600.6 , HORVU7Hr1G107600.1 , HORVU7Hr1G107600.3 , HORVU7Hr1G107600.2 , HORVU7Hr1G107600.9 , HORVU7Hr1G107600.8 , HORVU7Hr1G107600.10 , HORVU7Hr1G107600.7
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G224100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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4 Sobic.006G094800 - -
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6 Sobic.004G353650 - -
7 Sobic.007G107800 expressed protein -
8 Sobic.004G191901 - K09264: MADS-box transcription factor, plant
9 Sobic.005G021400 - -
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11 Sobic.003G337400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed K00487: trans-cinnamate 4-monooxygenase
12 Sobic.009G074200 - -
13 Sobic.005G005300 expressed protein -
14 Sobic.004G157050 - -
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17 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
18 Sobic.009G027200 tetraspanin family protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G229300 expressed protein -
20 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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