Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G229300.1
Synonym Sb10g027230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z7U6
Pfam -
Panther DB PTHR23172 PTHR23172:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G30280 : Chaperone DnaJ-domain superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g46440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018029 , Zm00025a041905
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G449800 , TraesCS7B02G363000 , TraesCS7A02G461600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G186066 - -
2 Sobic.010G192700 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
3 Sobic.003G120900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.005G021400 - -
5 Sobic.003G396050 - -
6 Sobic.005G005300 expressed protein -
7 Sobic.003G123950 - -
8 Sobic.001G293200 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
9 Sobic.008G106100 ureide permease, putative, expressed -
10 Sobic.008G156800 - -
11 Sobic.003G168700 "oxidative phosphorylation, ATP production, stroma side of thylakoid membranes"(PubMedID : 8481382)@cytochrome b6, putative, expressed K02635: cytochrome b6
12 Sobic.010G053700 expressed protein -
13 Sobic.001G097800 - -
14 Sobic.010G123650 - -
15 Sobic.008G116800 expressed protein -
16 Sobic.002G153600 expressed protein -
17 Sobic.009G229500 expressed protein -
18 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G229300 Sobic010G229300 Sobic003G186066 Sobic003G186066 Sobic010G229300--Sobic003G186066 Sobic010G192700 Sobic010G192700 Sobic010G229300--Sobic010G192700 Sobic003G120900 Sobic003G120900 Sobic010G229300--Sobic003G120900 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic010G229300--Sobic005G021400 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic010G229300--Sobic003G396050 Sobic005G005300 Sobic005G005300 Sobic010G229300--Sobic005G005300 Sobic003G123950 Sobic003G123950 Sobic010G229300--Sobic003G123950 Sobic001G293200 Sobic001G293200 Sobic010G229300--Sobic001G293200 Sobic008G106100 Sobic008G106100 Sobic010G229300--Sobic008G106100 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G186066--Sobic008G116800 Sobic003G186066--Sobic010G229300 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G186066--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G186066--Sobic004G129400 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G186066--Sobic002G147550 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G186066--Sobic008G156800 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic003G186066--Sobic010G053700 Sobic003G186066--Sobic005G021400 Sobic003G186066--Sobic003G396050 Sobic010G192700--Sobic010G229300 Sobic010G192700--Sobic003G186066 Sobic010G192700--Sobic003G120900 Sobic002G153600 Sobic002G153600 Sobic010G192700--Sobic002G153600 Sobic003G348900 Sobic003G348900 Sobic010G192700--Sobic003G348900 Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic010G192700--Sobic006G232100 Sobic006G112000 Sobic006G112000 Sobic010G192700--Sobic006G112000 Sobic003G008200 Sobic003G008200 Sobic010G192700--Sobic003G008200 Sobic001G097800 Sobic001G097800 Sobic010G192700--Sobic001G097800 Sobic003G120900--Sobic005G021400 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic003G120900--Sobic007G054200 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G120900--Sobic004G303433 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G120900--Sobic001G535850 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic003G120900--Sobic009G058900 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G120900--Sobic009G257000 Sobic010G196900 Sobic010G196900 Sobic003G120900--Sobic010G196900 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic003G120900--Sobic001G093400 Sobic003G120900--Sobic004G129400 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic005G021400--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic005G021400--Sobic009G204501 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic007G116300 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G021400--Sobic003G286450 Sobic005G021400--Sobic001G093400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic005G021400--Sobic001G255866 Sobic005G021400--Sobic010G053700 Sobic005G021400--Sobic001G535850 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic005G021400--Sobic001G420150 Sobic003G396050--Sobic003G123950 Sobic003G396050--Sobic010G053700 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic003G396050--Sobic006G033601 Sobic003G396050--Sobic008G156800 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic003G396050--Sobic002G170000 Sobic001G062066 Sobic001G062066 Sobic003G396050--Sobic001G062066 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic003G396050--Sobic004G143550 Sobic003G396050--Sobic008G116800 Sobic003G396050--Sobic003G112100 Sobic005G005300--Sobic003G396050 Sobic005G005300--Sobic006G033601 Sobic005G005300--Sobic001G062066 Sobic005G005300--Sobic003G123950 Sobic005G005300--Sobic010G053700 Sobic005G005300--Sobic003G186066 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic005G005300--Sobic010G123650 Sobic005G005300--Sobic008G116800 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic005G005300--Sobic001G499400 Sobic003G123950--Sobic008G156800 Sobic003G123950--Sobic003G396050 Sobic003G123950--Sobic010G123650 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic003G123950--Sobic003G168700 Sobic003G123950--Sobic003G112100 Sobic004G215650 Sobic004G215650 Sobic003G123950--Sobic004G215650 Sobic003G123950--Sobic002G170000 Sobic003G123950--Sobic004G129400 Sobic003G123950--Sobic010G053700 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic001G293200--Sobic009G184450 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic001G293200--Sobic001G087850 Sobic001G293200--Sobic010G123650 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic001G293200--Sobic006G171801 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G293200--Sobic006G065000 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic001G293200--Sobic010G028366 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G293200--Sobic004G023800 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic001G293200--Sobic001G436450 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G293200--Sobic004G207733 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic008G106100--Sobic005G090800 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic008G106100--Sobic004G193350 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic008G106100--Sobic001G400601 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic008G106100--Sobic002G157050 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic008G106100--Sobic001G016050 Sobic008G106100--Sobic005G021400 Sobic006G148600 Sobic006G148600 Sobic008G106100--Sobic006G148600 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G106100--Sobic001G205950 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic008G106100--Sobic002G067900
Octagon: transcription factors


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