Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G074200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7E8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
2 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
3 Sobic.003G369533 - -
4 Sobic.003G172500 - -
5 Sobic.004G087050 - -
6 Sobic.003G168200 - -
7 Sobic.009G016666 - -
8 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
9 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
10 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
11 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
12 Sobic.007G149200 "DEP1/GGC2(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659905)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
13 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
14 Sobic.003G171900 - -
15 Sobic.005G110493 - -
16 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
17 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
18 Sobic.002G278100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G160300 NADPH-dependent oxidoreductase, putative K05576: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L
20 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G074200 Sobic009G074200 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic009G074200--Sobic010G139200 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic009G074200--Sobic006G183100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic009G074200--Sobic003G369533 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic009G074200--Sobic003G172500 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G074200--Sobic004G087050 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic009G074200--Sobic003G168200 Sobic009G016666 Sobic009G016666 Sobic009G074200--Sobic009G016666 SobicK032300 SobicK032300 Sobic009G074200--SobicK032300 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic009G074200--Sobic003G168425 Sobic010G139200--Sobic004G087050 Sobic010G139200--Sobic003G168425 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic010G139200--Sobic005G110493 Sobic010G139200--Sobic003G172500 Sobic010G139200--Sobic003G168200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic010G139200--Sobic004G210400 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic010G139200--Sobic003G169300 Sobic010G139200--SobicK032300 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic010G139200--Sobic009G123100 Sobic006G183100--SobicK032300 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic006G124700 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic006G183100--Sobic001G230050 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic006G183100--Sobic010G206600 Sobic006G183100--Sobic003G172500 Sobic006G183100--Sobic009G123100 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic001G394532 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic006G183100--Sobic006G124800 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G183100--Sobic007G145801 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G369533--SobicK029400 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G369533--Sobic003G218950 Sobic003G369533--Sobic003G168200 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G369533--Sobic007G149200 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic005G116400 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic003G369533--Sobic007G065000 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G369533--Sobic003G352000 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G369566 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G369533--Sobic003G169000 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic004G087050 Sobic003G172500--Sobic009G123100 Sobic003G172500--SobicK032300 Sobic003G172500--Sobic010G139200 Sobic003G172500--Sobic005G110493 Sobic003G172500--Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic003G168425 Sobic003G172500--Sobic003G169300 Sobic004G087050--Sobic010G139200 Sobic004G087050--Sobic003G168425 Sobic004G087050--Sobic005G110493 Sobic004G087050--Sobic003G172500 Sobic004G087050--Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic004G210400 Sobic003G168200--Sobic007G149200 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic003G168200--Sobic002G278100 Sobic003G168200--Sobic003G352000 Sobic003G168200--SobicK029400 Sobic003G168200--Sobic004G087050 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic003G168200--Sobic010G201266 Sobic003G168200--Sobic010G139200 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168200--Sobic008G160300 Sobic003G168200--Sobic003G171900 Sobic009G016666--Sobic007G145801 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G016666--Sobic004G337850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic009G016666--Sobic010G035600 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic009G016666--Sobic005G139750 Sobic009G016666--Sobic007G065000 Sobic009G016666--Sobic009G123100 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic009G016666--Sobic001G450900 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic009G016666--Sobic001G022700 Sobic009G016666--Sobic006G183100 SobicK032300--Sobic001G230050 SobicK032300--Sobic003G172500 SobicK032300--Sobic006G124700 SobicK032300--Sobic010G206600 SobicK032300--Sobic009G123100 SobicK032300--Sobic006G183100 SobicK032300--Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 SobicK032300--Sobic003G169200 Sobic003G168425--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic005G110493 Sobic003G168425--Sobic010G139200 Sobic003G168425--Sobic003G169300 Sobic003G168425--Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic003G168425--Sobic003G130200 Sobic003G168425--Sobic004G210400 Sobic003G168425--Sobic008G160300
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