Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G212700.1
Synonym PBP1, Sb07g027990
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
EF hand family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PJ00
Pfam PF13833
Panther DB PTHR10891 PTHR10891:SF585
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G54490 : pinoid-binding protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g57470.1 : EF hand family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005050
Brachypodium KQK10090
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G083866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G212700 Sobic007G212700 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic007G212700--Sobic008G175600 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic007G212700--Sobic004G269500 Sobic002G312600 Sobic002G312600 Sobic007G212700--Sobic002G312600 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic007G212700--Sobic002G285950 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic007G212700--Sobic008G054400 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G212700--Sobic002G008701 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic007G212700--Sobic002G030001 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic007G212700--Sobic002G426650 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic007G212700--Sobic002G065300 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G175600--Sobic009G174600 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic008G175600--Sobic008G112400 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic008G175600--Sobic008G166250 Sobic008G175600--Sobic002G065300 Sobic008G175600--Sobic004G269500 Sobic008G175600--Sobic002G426650 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic008G175600--Sobic003G101600 Sobic008G175600--Sobic002G008701 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic008G175600--Sobic002G284300 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic004G269500--Sobic006G222650 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G269500--Sobic010G035300 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic004G269500--Sobic004G302400 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic004G269500--Sobic004G302550 Sobic004G269500--Sobic002G065300 Sobic004G269500--Sobic009G174600 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic004G269500--Sobic002G116300 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G269500--Sobic004G314750 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic004G269500--Sobic006G146400 Sobic004G102301 Sobic004G102301 Sobic002G312600--Sobic004G102301 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic002G312600--Sobic009G170301 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic002G312600--Sobic001G204200 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic002G312600--Sobic005G094500 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic002G312600--Sobic002G076932 Sobic009G235100 Sobic009G235100 Sobic002G312600--Sobic009G235100 Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic002G312600--Sobic001G206800 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic002G312600--Sobic006G093400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G312600--Sobic003G155350 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic002G285950--Sobic001G378150 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G285950--Sobic002G149550 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G285950--Sobic009G221701 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G285950--Sobic010G217466 Sobic002G331700 Sobic002G331700 Sobic002G285950--Sobic002G331700 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic002G285950--Sobic007G119300 Sobic002G285950--Sobic002G426650 Sobic002G285950--Sobic007G212700 Sobic006G208600 Sobic006G208600 Sobic002G285950--Sobic006G208600 Sobic008G054400--Sobic008G166250 Sobic008G054400--Sobic002G076932 Sobic008G054400--Sobic005G094500 Sobic008G054400--Sobic001G204200 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic008G054400--Sobic004G184500 Sobic008G054400--Sobic002G065300 Sobic008G054400--Sobic009G170301 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic008G054400--Sobic009G094000 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic008G054400--Sobic010G244701 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic002G008701--Sobic004G223350 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic002G008701--Sobic007G203850 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic002G008701--Sobic007G016300 Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic002G008701--Sobic003G015800 Sobic002G008701--Sobic008G175600 Sobic002G008701--Sobic008G112400 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic002G008701--Sobic005G083866 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic002G008701--Sobic002G331200 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic002G008701--Sobic001G296600 Sobic002G030001--Sobic005G083866 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic002G030001--Sobic002G380150 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic002G030001--Sobic004G200000 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic002G030001--Sobic010G217001 Sobic002G030001--Sobic007G016300 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic002G030001--Sobic002G018133 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G030001--Sobic003G043650 Sobic009G118700 Sobic009G118700 Sobic002G030001--Sobic009G118700 Sobic002G030001--Sobic002G076932 Sobic002G426650--Sobic008G112400 Sobic002G426650--Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic004G302550 Sobic002G426650--Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic002G065300 Sobic002G426650--Sobic009G174600 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic008G064900 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600
Octagon: transcription factors


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