Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G324500.1
Synonym ERF12, ATERF12
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt C5XMF2
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31677 PTHR31677:SF25
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28360 : ERF domain protein 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g41760.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039854 , Zm00025a027210
Brachypodium KQK10160 , KQK05592 , PNT61818 , KQK23628
Barley HORVU1Hr1G067160.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G212700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@EF hand family protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G331700 expressed protein -
3 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
4 Sobic.002G285950 - -
5 Sobic.003G224000 - -
6 Sobic.008G112400 - -
7 Sobic.002G426650 - -
8 Sobic.001G378150 - -
9 Sobic.007G070600 purine permease, putative, expressed -
10 Sobic.001G543600 tetraspanin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
12 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G054400 expressed protein -
14 Sobic.004G269500 transcription factor TF2, putative, expressed -
15 Sobic.002G008701 - -
16 Sobic.009G082500 - -
17 Sobic.001G062400 - -
18 Sobic.007G016300 - -
19 Sobic.007G119300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endoglucanase, putative, expressed -
20 Sobic.005G027032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G324500 Sobic003G324500 Sobic007G212700 Sobic007G212700 Sobic003G324500--Sobic007G212700 Sobic002G331700 Sobic002G331700 Sobic003G324500--Sobic002G331700 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic003G324500--Sobic002G065300 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic003G324500--Sobic002G285950 Sobic003G224000 Sobic003G224000 Sobic003G324500--Sobic003G224000 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic003G324500--Sobic008G112400 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic003G324500--Sobic002G426650 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic003G324500--Sobic001G378150 Sobic007G070600 Sobic007G070600 Sobic003G324500--Sobic007G070600 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic007G212700--Sobic008G175600 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic007G212700--Sobic004G269500 Sobic002G312600 Sobic002G312600 Sobic007G212700--Sobic002G312600 Sobic007G212700--Sobic002G285950 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic007G212700--Sobic008G054400 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G212700--Sobic002G008701 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic007G212700--Sobic002G030001 Sobic007G212700--Sobic002G426650 Sobic007G212700--Sobic002G065300 Sobic002G331700--Sobic002G426650 Sobic002G331700--Sobic008G112400 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic002G331700--Sobic007G119300 Sobic002G331700--Sobic002G065300 Sobic003G233300 Sobic003G233300 Sobic002G331700--Sobic003G233300 Sobic002G331700--Sobic002G285950 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G331700--Sobic004G302550 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G331700--Sobic008G064900 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic002G331700--Sobic007G016300 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic002G285950--Sobic001G378150 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G285950--Sobic002G149550 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G285950--Sobic009G221701 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G285950--Sobic010G217466 Sobic002G285950--Sobic002G331700 Sobic002G285950--Sobic007G119300 Sobic002G285950--Sobic002G426650 Sobic002G285950--Sobic007G212700 Sobic006G208600 Sobic006G208600 Sobic002G285950--Sobic006G208600 Sobic001G535601 Sobic001G535601 Sobic003G224000--Sobic001G535601 Sobic002G218200 Sobic002G218200 Sobic003G224000--Sobic002G218200 Sobic003G224000--Sobic007G070600 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic003G224000--Sobic001G410800 Sobic010G005401 Sobic010G005401 Sobic003G224000--Sobic010G005401 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic003G224000--Sobic006G065200 Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic003G224000--Sobic010G136601 Sobic001G300750 Sobic001G300750 Sobic003G224000--Sobic001G300750 Sobic003G224000--Sobic001G543600 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic002G426650--Sobic008G112400 Sobic002G426650--Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic004G302550 Sobic002G426650--Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic002G065300 Sobic002G426650--Sobic009G174600 Sobic002G426650--Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic004G302400 Sobic001G378150--Sobic002G285950 Sobic001G378150--Sobic007G119300 Sobic001G378150--Sobic010G217466 Sobic001G378150--Sobic009G221701 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic001G378150--Sobic002G429200 Sobic001G378150--Sobic002G149550 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic001G378150--Sobic002G246950 Sobic003G336400 Sobic003G336400 Sobic001G378150--Sobic003G336400 Sobic001G378150--Sobic003G224000 Sobic007G070600--Sobic003G224000 Sobic007G070600--Sobic001G535601 Sobic007G070600--Sobic001G378150 Sobic005G008301 Sobic005G008301 Sobic007G070600--Sobic005G008301 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic007G070600--Sobic001G062400 Sobic003G013400 Sobic003G013400 Sobic007G070600--Sobic003G013400 Sobic005G232200 Sobic005G232200 Sobic007G070600--Sobic005G232200 Sobic007G070600--Sobic002G218200 Sobic001G139600 Sobic001G139600 Sobic007G070600--Sobic001G139600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.