Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G000700.1
Synonym Sb08g000240
Functional annotation RNase P subunit p30, putative, expressed
UniProt C5YPP9
Pfam PF06203
Panther DB PTHR31319 PTHR31319:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G41380 : CCT motif family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g16160.1 : CCT motif family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027936 , Zm00025a028907 , Zm00025a003663
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G152500 tetraacyldisaccharide 4-kinase, putative, expressed K00912: tetraacyldisaccharide 4'-kinase
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20 Sobic.002G095300 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed K00893: deoxycitidine kinase


Gene co-expression network
sample Sobic008G000700 Sobic008G000700 Sobic008G152500 Sobic008G152500 Sobic008G000700--Sobic008G152500 Sobic003G354500 Sobic003G354500 Sobic008G000700--Sobic003G354500 Sobic001G043700 Sobic001G043700 Sobic008G000700--Sobic001G043700 Sobic008G174500 Sobic008G174500 Sobic008G000700--Sobic008G174500 Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic008G000700--Sobic008G090400 Sobic006G192800 Sobic006G192800 Sobic008G000700--Sobic006G192800 Sobic008G112100 Sobic008G112100 Sobic008G000700--Sobic008G112100 Sobic002G123600 Sobic002G123600 Sobic008G000700--Sobic002G123600 Sobic003G331000 Sobic003G331000 Sobic008G000700--Sobic003G331000 Sobic006G257600 Sobic006G257600 Sobic008G152500--Sobic006G257600 Sobic008G029900 Sobic008G029900 Sobic008G152500--Sobic008G029900 Sobic008G152500--Sobic008G000700 Sobic008G152500--Sobic006G192800 Sobic007G116766 Sobic007G116766 Sobic008G152500--Sobic007G116766 Sobic009G113100 Sobic009G113100 Sobic008G152500--Sobic009G113100 Sobic001G423300 Sobic001G423300 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Octagon: transcription factors


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