Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G192800.1
Synonym MCD1, Sb06g026560
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YEL0
Pfam -
Panther DB PTHR36317 PTHR36317:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20830 : multiple chloroplast division site 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010056 , Zm00025a056697
Brachypodium KQJ84222
Barley HORVU2Hr1G104660.7 , HORVU2Hr1G104660.6 , HORVU2Hr1G104660.4 , HORVU2Hr1G104660.9 , HORVU2Hr1G104660.8
Wheat TraesCS2A02G455800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G192800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G041100 ATEXO70G1, putative, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
2 Sobic.005G160200 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G313500 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
4 Sobic.008G056200 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G028400 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G123600 domain of unknown function, DUF250 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G026400 expressed protein -
8 Sobic.008G152500 tetraacyldisaccharide 4-kinase, putative, expressed K00912: tetraacyldisaccharide 4'-kinase
9 Sobic.003G331000 exostosin family domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G164500 meiosis 5, putative, expressed -
11 Sobic.001G138900 expressed protein -
12 Sobic.002G354700 zinc finger family protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G029900 expressed protein -
14 Sobic.009G205400 RING-H2 finger protein ATL2M, putative, expressed -
15 Sobic.003G411700 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
16 Sobic.001G423300 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
17 Sobic.003G304800 OsRhmbd4 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
18 Sobic.003G050700 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
19 Sobic.009G122900 alpha 1,3-xylosyltransferase, putative, expressed K11714: rhamnogalacturonan II specific xylosyltransferase
20 Sobic.002G386900 pseudouridylate synthase, putative, expressed K06176: truD, tRNA pseudouridine13 synthase


Gene co-expression network
sample Sobic006G192800 Sobic006G192800 Sobic004G041100 Sobic004G041100 Sobic006G192800--Sobic004G041100 Sobic005G160200 Sobic005G160200 Sobic006G192800--Sobic005G160200 Sobic004G313500 Sobic004G313500 Sobic006G192800--Sobic004G313500 Sobic008G056200 Sobic008G056200 Sobic006G192800--Sobic008G056200 Sobic003G028400 Sobic003G028400 Sobic006G192800--Sobic003G028400 Sobic001G123600 Sobic001G123600 Sobic006G192800--Sobic001G123600 Sobic008G026400 Sobic008G026400 Sobic006G192800--Sobic008G026400 Sobic008G152500 Sobic008G152500 Sobic006G192800--Sobic008G152500 Sobic003G331000 Sobic003G331000 Sobic006G192800--Sobic003G331000 Sobic001G425200 Sobic001G425200 Sobic004G041100--Sobic001G425200 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic004G041100--Sobic003G411700 Sobic007G197100 Sobic007G197100 Sobic004G041100--Sobic007G197100 Sobic003G298900 Sobic003G298900 Sobic004G041100--Sobic003G298900 Sobic009G005700 Sobic009G005700 Sobic004G041100--Sobic009G005700 Sobic001G043700 Sobic001G043700 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Octagon: transcription factors


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