Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G152500.5
Synonym Sb08g020160
Functional annotation tetraacyldisaccharide 4-kinase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R6V8
Pfam PF02606
Panther DB PTHR30160 PTHR30160:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00912; tetraacyldisaccharide 4'-kinase
Gene Ontology GO:0009245; lipid A biosynthetic process GO:0009029tetraacyldisaccharide 4'-kinase activity GO:0005524ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G20480 : tetraacyldisaccharide 4\'-kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01200.1 : tetraacyldisaccharide 4-kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004550
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G064900.30 , HORVU2Hr1G064900.33 , HORVU2Hr1G064900.32 , HORVU2Hr1G064900.34 , HORVU2Hr1G064900.9 , HORVU2Hr1G064900.6 , HORVU2Hr1G064900.5 , HORVU2Hr1G064900.4 , HORVU2Hr1G064900.3 , HORVU2Hr1G064900.2 , HORVU2Hr1G064900.1 , HORVU2Hr1G064900.29 , HORVU2Hr1G064900.27 , HORVU2Hr1G064900.24 , HORVU2Hr1G064900.25 , HORVU2Hr1G064900.22 , HORVU2Hr1G064900.23 , HORVU2Hr1G064900.20 , HORVU2Hr1G064900.21 , HORVU2Hr1G064900.17 , HORVU2Hr1G064900.16 , HORVU2Hr1G064900.15 , HORVU2Hr1G064900.14 , HORVU2Hr1G064900.13 , HORVU2Hr1G064900.12 , HORVU2Hr1G064900.11 , HORVU2Hr1G064900.10 , HORVU2Hr1G064900.19 , HORVU2Hr1G064900.18
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G257600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed K05609: UCHL3, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L3
2 Sobic.008G029900 expressed protein -
3 Sobic.008G000700 RNase P subunit p30, putative, expressed -
4 Sobic.006G192800 expressed protein -
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19 Sobic.009G208200 WD repeat-containing protein 55, putative, expressed -
20 Sobic.001G067000 expressed protein K12606: RCD1, CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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