Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G208200.2,Sobic.009G208200.1
Synonym
Functional annotation WD repeat-containing protein 55, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R3J9 , A0A1B6P9Q1
Pfam PF00400
Panther DB PTHR22840
NCBI CDD KOG2444; WD40 repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34260 : transducin family protein / WD-40 repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46620.1 : WD repeat-containing protein 55, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044258 , Zm00025a037416
Brachypodium KQK05244
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G208200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G208200 Sobic009G208200 Sobic008G018800 Sobic008G018800 Sobic009G208200--Sobic008G018800 Sobic002G395700 Sobic002G395700 Sobic009G208200--Sobic002G395700 Sobic006G017600 Sobic006G017600 Sobic009G208200--Sobic006G017600 Sobic009G132600 Sobic009G132600 Sobic009G208200--Sobic009G132600 Sobic003G129300 Sobic003G129300 Sobic009G208200--Sobic003G129300 Sobic009G030400 Sobic009G030400 Sobic009G208200--Sobic009G030400 Sobic009G002000 Sobic009G002000 Sobic009G208200--Sobic009G002000 Sobic002G142700 Sobic002G142700 Sobic009G208200--Sobic002G142700 Sobic008G160500 Sobic008G160500 Sobic009G208200--Sobic008G160500 Sobic008G018800--Sobic002G395700 Sobic001G007800 Sobic001G007800 Sobic008G018800--Sobic001G007800 Sobic008G018800--Sobic009G002000 Sobic001G334100 Sobic001G334100 Sobic008G018800--Sobic001G334100 Sobic008G018800--Sobic009G208200 Sobic002G277200 Sobic002G277200 Sobic008G018800--Sobic002G277200 Sobic002G005000 Sobic002G005000 Sobic008G018800--Sobic002G005000 Sobic004G307500 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Octagon: transcription factors


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