Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G395700.2
Synonym RAD51D, ATRAD51D, Sb02g041080, SSN1
Functional annotation DNA repair protein RAD51 homolog 4, putative, expressed
UniProt A0A1B6QFW9
Pfam PF08423
Panther DB PTHR22942:SF29 PTHR22942
NCBI CDD KOG1564; DNA repair protein RHP57
KEGG Orthology K10871; RAD51L3, RAD51-like protein 3
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G07745 : homolog of RAD51 D
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g01680.1 : DNA repair protein RAD51 homolog 4, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048961
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G444800 , TraesCS7D02G444800 , TraesCS7A02G455900 , TraesCS7B02G356900 , TraesCS7B02G356900 , TraesCS7B02G356900 , TraesCS7B02G356900
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cDNA sequences
Sobic.002G395700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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9 Sobic.004G067400 expressed protein -
10 Sobic.010G264000 expressed protein(PubMedID : 28640841)@expressed protein -
11 Sobic.001G007800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11806: DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13
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13 Sobic.001G004100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
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18 Sobic.004G330000 - K14807: DDX51, ATP-dependent RNA helicase DDX51/DBP6
19 Sobic.001G413800 expressed protein K13141: integrator complex subunit 4
20 Sobic.003G222700 similar to DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 26(PubMedID : 29862293)@- K17679: ATP-dependent RNA helicase MSS116, mitochondrial


Gene co-expression network
sample Sobic002G395700 Sobic002G395700 Sobic008G018800 Sobic008G018800 Sobic002G395700--Sobic008G018800 Sobic003G222000 Sobic003G222000 Sobic002G395700--Sobic003G222000 Sobic002G369701 Sobic002G369701 Sobic002G395700--Sobic002G369701 Sobic008G160500 Sobic008G160500 Sobic002G395700--Sobic008G160500 Sobic004G020100 Sobic004G020100 Sobic002G395700--Sobic004G020100 Sobic001G471000 Sobic001G471000 Sobic002G395700--Sobic001G471000 Sobic002G006401 Sobic002G006401 Sobic002G395700--Sobic002G006401 Sobic007G042900 Sobic007G042900 Sobic002G395700--Sobic007G042900 Sobic004G067400 Sobic004G067400 Sobic002G395700--Sobic004G067400 Sobic008G018800--Sobic002G395700 Sobic001G007800 Sobic001G007800 Sobic008G018800--Sobic001G007800 Sobic009G002000 Sobic009G002000 Sobic008G018800--Sobic009G002000 Sobic001G334100 Sobic001G334100 Sobic008G018800--Sobic001G334100 Sobic009G208200 Sobic009G208200 Sobic008G018800--Sobic009G208200 Sobic002G277200 Sobic002G277200 Sobic008G018800--Sobic002G277200 Sobic002G005000 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Octagon: transcription factors


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