Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G044450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBF6
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19090 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g06990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ87840
Barley -
Wheat TraesCS4A02G451600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G199800 cyclic phosphodiesterase, putative, expressed -
2 Sobic.003G339300 expressed protein -
3 Sobic.007G123700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G029500 GDP-mannose transporter, putative, expressed K15356: VRG4, GDP-mannose transporter
5 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
6 Sobic.004G282933 - -
7 Sobic.001G054050 - -
8 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
9 Sobic.008G024900 expressed protein -
10 Sobic.002G040550 - -
11 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.003G172450 - -
13 Sobic.003G097701 - -
14 Sobic.003G160300 - -
15 Sobic.002G180732 - -
16 Sobic.008G140050 - -
17 Sobic.010G225400 expressed protein -
18 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
19 Sobic.003G160433 - -
20 Sobic.009G087480 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G044450 Sobic008G044450 Sobic009G199800 Sobic009G199800 Sobic008G044450--Sobic009G199800 Sobic003G339300 Sobic003G339300 Sobic008G044450--Sobic003G339300 Sobic007G123700 Sobic007G123700 Sobic008G044450--Sobic007G123700 Sobic001G029500 Sobic001G029500 Sobic008G044450--Sobic001G029500 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic008G044450--Sobic003G050100 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic008G044450--Sobic004G282933 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic008G044450--Sobic001G054050 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic008G044450--Sobic006G139200 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic008G044450--Sobic008G024900 Sobic009G199800--Sobic008G044450 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic009G199800--Sobic003G172450 Sobic009G199800--Sobic006G139200 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic009G199800--Sobic002G040550 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic009G199800--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic009G199800--Sobic002G397700 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic009G199800--Sobic004G234766 Sobic009G199800--Sobic007G123700 Sobic009G199800--Sobic008G024900 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic003G339300--Sobic004G322650 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G339300--Sobic003G160433 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic003G339300--Sobic002G180732 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G339300--Sobic005G216900 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic003G339300--Sobic004G157050 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G339300--Sobic003G160300 Sobic003G339300--Sobic001G054050 Sobic003G339300--Sobic003G050100 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic003G339300--Sobic008G171200 Sobic007G123700--Sobic006G139200 Sobic007G123700--Sobic002G040550 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic007G123700--Sobic009G087480 Sobic007G123700--Sobic003G172450 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic007G123700--Sobic002G390200 Sobic007G123700--Sobic008G024900 Sobic007G123700--Sobic002G180732 Sobic007G123700--Sobic004G282933 Sobic007G123700--Sobic010G107901 Sobic001G029500--Sobic004G282933 Sobic001G029500--Sobic001G054050 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic001G029500--Sobic007G085900 Sobic001G029500--Sobic003G160300 Sobic001G029500--Sobic003G160433 Sobic001G029500--Sobic003G050100 Sobic001G029500--Sobic002G390200 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic001G029500--Sobic001G128000 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G029500--Sobic009G192200 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic003G050100--Sobic003G330350 Sobic003G050100--Sobic003G160300 Sobic003G050100--Sobic003G160433 Sobic003G050100--Sobic007G085900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G050100--Sobic006G057100 Sobic003G050100--Sobic009G192200 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G050100--Sobic003G218950 Sobic003G050100--Sobic005G216900 Sobic003G050100--Sobic002G390200 Sobic004G282933--Sobic009G192200 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic004G282933--Sobic004G104200 Sobic004G282933--Sobic007G085900 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic004G282933--Sobic008G140050 Sobic004G282933--Sobic003G160300 Sobic004G282933--Sobic002G390200 Sobic004G282933--Sobic001G054050 Sobic004G282933--Sobic008G024900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic004G282933--Sobic003G160400 Sobic001G054050--Sobic007G085900 Sobic001G054050--Sobic003G160400 Sobic001G054050--Sobic003G160300 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic008G140050 Sobic001G054050--Sobic003G160433 Sobic001G054050--Sobic005G216900 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic001G054050--Sobic005G167100 Sobic001G054050--Sobic001G128000 Sobic006G139200--Sobic002G040550 Sobic006G139200--Sobic003G172450 Sobic006G139200--Sobic002G390200 Sobic006G139200--Sobic002G180732 Sobic006G139200--Sobic009G087480 Sobic006G139200--Sobic010G107901 Sobic006G139200--Sobic002G397700 Sobic006G139200--Sobic003G160300 Sobic006G139200--Sobic004G234766 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic008G024900--Sobic006G093550 Sobic008G024900--Sobic004G234766 Sobic008G024900--Sobic010G107901 Sobic008G024900--Sobic002G397700 Sobic008G024900--Sobic003G172450 Sobic008G024900--Sobic001G054050 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic008G024900--Sobic002G322101 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic008G024900--Sobic001G249900 Sobic008G024900--Sobic005G167100
Octagon: transcription factors


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