Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G088878.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDQ3 , A0A1Z5R5Q5
Pfam -
Panther DB PTHR33184 PTHR33184:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G32583 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g28750.1 : TPD1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054140
Brachypodium PNT62724 , KQJ86765
Barley -
Wheat TraesCS2B02G096400 , TraesCS2D02G080200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G015900 thaumatin, putative, expressed -
2 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
3 Sobic.001G310900 expressed protein -
4 Sobic.009G037300 transferase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G139400 expressed protein -
6 Sobic.004G215000 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.007G125400 lysM domain containing protein, putative -
8 Sobic.003G120600 transmembrane protein 136, putative, expressed -
9 Sobic.004G340000 expressed protein -
10 Sobic.004G227900 expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G023700 expressed protein -
12 Sobic.002G068400 - -
13 Sobic.005G054800 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
14 Sobic.003G041801 - -
15 Sobic.004G041700 expressed protein -
16 Sobic.001G266100 POEI14 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
17 Sobic.010G222501 - K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.006G219100 expressed protein -
19 Sobic.010G065700 expressed protein -
20 Sobic.002G382500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G088878 Sobic008G088878 Sobic006G015900 Sobic006G015900 Sobic008G088878--Sobic006G015900 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic008G088878--Sobic010G027700 Sobic001G310900 Sobic001G310900 Sobic008G088878--Sobic001G310900 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic008G088878--Sobic009G037300 Sobic008G139400 Sobic008G139400 Sobic008G088878--Sobic008G139400 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic008G088878--Sobic004G215000 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic008G088878--Sobic007G125400 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic008G088878--Sobic003G120600 Sobic004G340000 Sobic004G340000 Sobic008G088878--Sobic004G340000 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic006G015900--Sobic006G219100 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic006G015900--Sobic004G227900 Sobic006G015900--Sobic004G215000 Sobic006G015900--Sobic010G027700 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic006G015900--Sobic007G094200 Sobic004G045500 Sobic004G045500 Sobic006G015900--Sobic004G045500 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic006G015900--Sobic008G004200 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic006G015900--Sobic004G342000 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic006G015900--Sobic001G179400 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic004G215000 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic010G027700--Sobic001G438500 Sobic010G027700--Sobic007G125400 Sobic010G027700--Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic001G179400 Sobic010G027700--Sobic007G094200 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic010G027700--Sobic002G023700 Sobic010G027700--Sobic009G037300 Sobic001G310900--Sobic007G094200 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic001G310900--Sobic008G154700 Sobic001G310900--Sobic006G219100 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic001G310900--Sobic003G300400 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic001G310900--Sobic003G116100 Sobic001G310900--Sobic010G027700 Sobic002G382500 Sobic002G382500 Sobic001G310900--Sobic002G382500 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic001G310900--Sobic002G416400 Sobic003G339600 Sobic003G339600 Sobic001G310900--Sobic003G339600 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic009G037300--Sobic002G183800 Sobic009G037300--Sobic010G027700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic009G037300--Sobic008G012600 Sobic009G037300--Sobic002G023700 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic009G037300--Sobic005G110900 Sobic009G037300--Sobic003G120600 Sobic009G037300--Sobic007G125400 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic009G037300--Sobic009G254500 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic009G037300--Sobic001G266100 Sobic008G139400--Sobic009G037300 Sobic008G139400--Sobic002G183800 Sobic008G139400--Sobic003G300400 Sobic002G419200 Sobic002G419200 Sobic008G139400--Sobic002G419200 Sobic008G139400--Sobic003G339600 Sobic006G044200 Sobic006G044200 Sobic008G139400--Sobic006G044200 Sobic008G139400--Sobic003G116100 Sobic008G139400--Sobic002G382500 Sobic005G197200 Sobic005G197200 Sobic008G139400--Sobic005G197200 Sobic004G215000--Sobic001G438500 Sobic004G215000--Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic004G227900 Sobic004G215000--Sobic001G179400 Sobic004G215000--Sobic002G068400 Sobic005G201900 Sobic005G201900 Sobic004G215000--Sobic005G201900 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic003G120600 Sobic004G215000--Sobic008G004200 Sobic007G125400--Sobic003G120600 Sobic007G125400--Sobic008G004200 Sobic007G125400--Sobic001G266100 Sobic007G125400--Sobic008G012600 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic007G125400--Sobic002G179200 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic007G125400--Sobic003G011700 Sobic007G125400--Sobic010G027700 Sobic002G047366 Sobic002G047366 Sobic007G125400--Sobic002G047366 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic007G125400--Sobic006G151800 Sobic003G120600--Sobic007G125400 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic003G120600--Sobic003G004900 Sobic003G120600--Sobic008G004200 Sobic003G120600--Sobic002G179200 Sobic003G120600--Sobic001G438500 Sobic003G120600--Sobic001G179400 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic003G120600--Sobic006G092300 Sobic003G120600--Sobic010G065700 Sobic003G120600--Sobic008G012600 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic004G340000--Sobic001G488400 Sobic005G188500 Sobic005G188500 Sobic004G340000--Sobic005G188500 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic004G340000--Sobic007G012800 Sobic004G340000--Sobic006G044200 Sobic004G340000--Sobic010G027700 Sobic008G035400 Sobic008G035400 Sobic004G340000--Sobic008G035400 Sobic004G340000--Sobic002G068400 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic004G340000--Sobic010G107200 Sobic004G340000--Sobic002G382500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.