Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G095150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5V6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054127
Brachypodium KQJ86748
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
2 Sobic.003G286450 - -
3 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
4 Sobic.001G535850 - -
5 Sobic.010G035600 - -
6 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
7 Sobic.002G083332 - -
8 Sobic.002G159750 - -
9 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
10 Sobic.001G358366 - -
11 Sobic.001G182900 - -
12 Sobic.010G267300 thaumatin, putative, expressed -
13 Sobic.001G476800 - -
14 Sobic.004G303433 - K02950: RP-S12, MRPS12, small subunit ribosomal protein S12
15 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G019550 - -
17 Sobic.004G015600 - -
18 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
19 Sobic.010G176000 - -
20 Sobic.009G204501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G095150 Sobic008G095150 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic008G095150--Sobic007G065000 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic008G095150--Sobic003G286450 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic008G095150--Sobic001G394532 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic008G095150--Sobic001G535850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic008G095150--Sobic010G035600 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic008G095150--Sobic008G171200 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic008G095150--Sobic002G083332 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic008G095150--Sobic002G159750 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic008G095150--Sobic010G206600 Sobic007G065000--Sobic010G035600 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic007G065000--Sobic003G169000 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G065000--Sobic003G169100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic007G065000--Sobic003G369533 SobicK029400 SobicK029400 Sobic007G065000--SobicK029400 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic010G206600 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic007G065000--Sobic003G352000 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic007G065000--Sobic003G168200 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic001G394532--Sobic010G206600 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic001G394532--Sobic001G230050 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic001G394532--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G394532--SobicK032300 Sobic001G394532--Sobic001G535850 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G394532--Sobic005G139900 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic001G394532--Sobic001G530201 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic001G394532--Sobic006G183100 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G394532--Sobic009G174150 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic010G035600--Sobic010G185250 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic008G171200--Sobic001G476800 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic008G171200--Sobic004G157050 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic008G171200--Sobic007G113566 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic008G171200--Sobic004G207800 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic008G171200--Sobic010G175550 Sobic008G171200--Sobic010G035600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G182900 Sobic008G171200--Sobic003G286450 Sobic002G083332--Sobic001G530201 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G159750 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic001G394532 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic002G083332--Sobic001G358366 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic002G083332--Sobic009G204501 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic002G083332--Sobic001G182700 Sobic002G083332--Sobic005G139900 Sobic002G159750--Sobic003G286450 Sobic002G159750--Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G476800 Sobic002G159750--Sobic005G139750 Sobic002G159750--Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G182900 Sobic002G159750--Sobic010G175550 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic002G159750--Sobic004G077700 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic010G206600--Sobic003G169200 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic010G206600--Sobic009G174150
Octagon: transcription factors


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