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Transcriptome id Sobic.008G100950.2,Sobic.008G100950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5W9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G237350 - -
2 Sobic.004G338400 "TH1(Ortholog in rice:Li et al., 2012)"(PubMedID : 31659894)@DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G197500 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G054901 - -
5 Sobic.010G091366 - -
6 Sobic.006G053500 expressed protein K10990: RMI1, RecQ-mediated genome instability protein 1
7 Sobic.003G399900 pentatricopeptide repeat protein PPR1106-17, putative, expressed -
8 Sobic.008G153900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G131350 - -
10 Sobic.004G281750 - -
11 Sobic.001G041450 - -
12 Sobic.007G141001 - -
13 Sobic.002G327500 TKL_IRAK_DUF26-lc.10 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
14 Sobic.004G087200 flavonol-3-O-glycoside-7-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
15 Sobic.002G284600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSAUR39 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
16 Sobic.010G202900 expressed protein -
17 Sobic.007G075200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@bifunctional purine biosynthesis protein purH, putative, expressed K00602: phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase / IMP cyclohydrolase
18 Sobic.003G034250 - -
19 Sobic.008G182500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
20 Sobic.004G082200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G100950 Sobic008G100950 Sobic009G237350 Sobic009G237350 Sobic008G100950--Sobic009G237350 Sobic004G338400 Sobic004G338400 Sobic008G100950--Sobic004G338400 Sobic006G197500 Sobic006G197500 Sobic008G100950--Sobic006G197500 Sobic002G054901 Sobic002G054901 Sobic008G100950--Sobic002G054901 Sobic010G091366 Sobic010G091366 Sobic008G100950--Sobic010G091366 Sobic006G053500 Sobic006G053500 Sobic008G100950--Sobic006G053500 Sobic003G399900 Sobic003G399900 Sobic008G100950--Sobic003G399900 Sobic008G153900 Sobic008G153900 Sobic008G100950--Sobic008G153900 Sobic004G131350 Sobic004G131350 Sobic008G100950--Sobic004G131350 Sobic008G178200 Sobic008G178200 Sobic009G237350--Sobic008G178200 Sobic008G178300 Sobic008G178300 Sobic009G237350--Sobic008G178300 Sobic002G284600 Sobic002G284600 Sobic009G237350--Sobic002G284600 Sobic009G237350--Sobic008G100950 Sobic009G237350--Sobic010G091366 Sobic009G237350--Sobic008G153900 Sobic009G237350--Sobic004G338400 Sobic009G237350--Sobic002G054901 Sobic003G316400 Sobic003G316400 Sobic009G237350--Sobic003G316400 Sobic004G338400--Sobic010G091366 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic004G338400--Sobic005G156800 Sobic004G082200 Sobic004G082200 Sobic004G338400--Sobic004G082200 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic004G338400--Sobic002G380750 Sobic004G338400--Sobic006G053500 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G338400--Sobic005G181700 Sobic001G307450 Sobic001G307450 Sobic004G338400--Sobic001G307450 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic004G338400--Sobic007G141001 Sobic003G034250 Sobic003G034250 Sobic004G338400--Sobic003G034250 Sobic008G182500 Sobic008G182500 Sobic006G197500--Sobic008G182500 Sobic006G197500--Sobic008G100950 Sobic009G241966 Sobic009G241966 Sobic006G197500--Sobic009G241966 Sobic009G109101 Sobic009G109101 Sobic006G197500--Sobic009G109101 Sobic002G316000 Sobic002G316000 Sobic006G197500--Sobic002G316000 Sobic006G197500--Sobic009G237350 Sobic001G490700 Sobic001G490700 Sobic006G197500--Sobic001G490700 Sobic001G442800 Sobic001G442800 Sobic006G197500--Sobic001G442800 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic006G197500--Sobic003G038000 Sobic004G281750 Sobic004G281750 Sobic002G054901--Sobic004G281750 Sobic002G054901--Sobic008G153900 Sobic003G188900 Sobic003G188900 Sobic002G054901--Sobic003G188900 Sobic002G054901--Sobic002G284600 Sobic002G054901--Sobic009G237350 Sobic002G054901--Sobic008G100950 Sobic002G054901--Sobic007G141001 Sobic010G103000 Sobic010G103000 Sobic002G054901--Sobic010G103000 Sobic002G054901--Sobic004G131350 Sobic010G091366--Sobic005G181700 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic010G091366--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic010G091366--Sobic003G318400 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic010G091366--Sobic007G059800 Sobic010G091366--Sobic003G034250 Sobic010G091366--Sobic006G053500 Sobic010G091366--Sobic004G082200 Sobic009G150100 Sobic009G150100 Sobic010G091366--Sobic009G150100 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic010G091366--Sobic004G201200 Sobic006G053500--Sobic003G034250 Sobic008G154000 Sobic008G154000 Sobic006G053500--Sobic008G154000 Sobic003G091100 Sobic003G091100 Sobic006G053500--Sobic003G091100 Sobic010G229200 Sobic010G229200 Sobic006G053500--Sobic010G229200 Sobic001G218701 Sobic001G218701 Sobic006G053500--Sobic001G218701 Sobic007G024900 Sobic007G024900 Sobic006G053500--Sobic007G024900 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic006G053500--Sobic007G100275 Sobic003G058400 Sobic003G058400 Sobic006G053500--Sobic003G058400 SobicK042700 SobicK042700 Sobic006G053500--SobicK042700 Sobic003G399900--Sobic006G053500 Sobic010G202900 Sobic010G202900 Sobic003G399900--Sobic010G202900 Sobic005G110550 Sobic005G110550 Sobic003G399900--Sobic005G110550 Sobic002G279200 Sobic002G279200 Sobic003G399900--Sobic002G279200 Sobic003G399900--Sobic003G316400 Sobic003G399900--Sobic004G338400 Sobic005G008700 Sobic005G008700 Sobic003G399900--Sobic005G008700 Sobic003G399900--Sobic010G091366 Sobic008G072050 Sobic008G072050 Sobic003G399900--Sobic008G072050 Sobic008G153900--Sobic007G141001 Sobic008G153900--Sobic004G082200 Sobic008G153900--Sobic006G053500 Sobic004G019900 Sobic004G019900 Sobic008G153900--Sobic004G019900 Sobic008G153900--Sobic003G091100 Sobic008G153900--Sobic004G131350 Sobic008G153900--Sobic010G091366 Sobic008G153900--Sobic001G218701 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic008G153900--Sobic001G272300 Sobic004G131350--Sobic008G153900 Sobic004G131350--Sobic006G053500 Sobic004G131350--Sobic010G091366 Sobic001G318366 Sobic001G318366 Sobic004G131350--Sobic001G318366 Sobic004G131350--Sobic004G082200 Sobic004G131350--Sobic007G141001 Sobic004G131350--Sobic004G338400 Sobic001G041450 Sobic001G041450 Sobic004G131350--Sobic001G041450 Sobic004G131350--Sobic005G156800
Octagon: transcription factors


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