Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G138600.1
Synonym Sb08g018940
Functional annotation SCARECROW, putative, expressed
UniProt C5YQA7
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29060 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38490.1 : SCARECROW, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025399 , Zm00025a004272
Brachypodium KQJ86191 , PNT62874 , KQJ87045
Barley -
Wheat TraesCS5A02G080300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G138600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G132800 expressed protein -
2 Sobic.005G111100 SKP1-like protein 1B, putative, expressed K03094: SKP1, S-phase kinase-associated protein 1
3 Sobic.004G032000 peptidase, T1 family, putative, expressed K02725: 20S proteasome subunit alpha 6
4 Sobic.001G294000 LOL3, putative, expressed -
5 Sobic.005G157200 prefoldin subunit, putative, expressed K09549: prefoldin subunit 2
6 Sobic.010G065400 X0001, putative, expressed -
7 Sobic.006G150600 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
8 Sobic.010G054200 peptidase, T1 family, putative, expressed K02728: 20S proteasome subunit alpha 3
9 Sobic.001G040300 expressed protein -
10 Sobic.006G222400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G029400 peptidase, T1 family, putative, expressed K02738: 20S proteasome subunit beta 1
12 Sobic.001G090000 expressed protein -
13 Sobic.009G016201 - K09481: SEC61B, protein transport protein SEC61 subunit beta
14 Sobic.008G135000 60S ribosomal protein L8, putative, expressed K02938: RP-L8e, large subunit ribosomal protein L8e
15 Sobic.003G362400 G10 protein, putative, expressed K12873: BUD31, bud site selection protein 31
16 Sobic.005G092800 expressed protein -
17 Sobic.001G335400 protein of unknown function DUF1675 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G529000 THO complex subunit 7, putative, expressed K13176: THO complex subunit 7
19 Sobic.007G226100 14-3-3 protein, putative, expressed K06630: 14-3-3 protein epsilon
20 Sobic.006G143500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G138600 Sobic008G138600 Sobic008G132800 Sobic008G132800 Sobic008G138600--Sobic008G132800 Sobic005G111100 Sobic005G111100 Sobic008G138600--Sobic005G111100 Sobic004G032000 Sobic004G032000 Sobic008G138600--Sobic004G032000 Sobic001G294000 Sobic001G294000 Sobic008G138600--Sobic001G294000 Sobic005G157200 Sobic005G157200 Sobic008G138600--Sobic005G157200 Sobic010G065400 Sobic010G065400 Sobic008G138600--Sobic010G065400 Sobic006G150600 Sobic006G150600 Sobic008G138600--Sobic006G150600 Sobic010G054200 Sobic010G054200 Sobic008G138600--Sobic010G054200 Sobic001G040300 Sobic001G040300 Sobic008G138600--Sobic001G040300 Sobic010G029400 Sobic010G029400 Sobic008G132800--Sobic010G029400 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic008G132800--Sobic002G078400 Sobic009G016201 Sobic009G016201 Sobic008G132800--Sobic009G016201 Sobic001G331900 Sobic001G331900 Sobic008G132800--Sobic001G331900 Sobic004G066800 Sobic004G066800 Sobic008G132800--Sobic004G066800 Sobic001G105100 Sobic001G105100 Sobic008G132800--Sobic001G105100 Sobic008G132800--Sobic005G157200 Sobic008G132800--Sobic010G065400 Sobic003G217100 Sobic003G217100 Sobic008G132800--Sobic003G217100 Sobic001G128400 Sobic001G128400 Sobic005G111100--Sobic001G128400 Sobic003G129800 Sobic003G129800 Sobic005G111100--Sobic003G129800 Sobic005G111100--Sobic004G032000 Sobic005G111100--Sobic004G066800 Sobic003G280700 Sobic003G280700 Sobic005G111100--Sobic003G280700 Sobic007G152400 Sobic007G152400 Sobic005G111100--Sobic007G152400 Sobic005G111100--Sobic010G054200 Sobic006G231700 Sobic006G231700 Sobic005G111100--Sobic006G231700 Sobic002G218000 Sobic002G218000 Sobic005G111100--Sobic002G218000 Sobic001G517600 Sobic001G517600 Sobic004G032000--Sobic001G517600 Sobic004G032000--Sobic003G129800 Sobic004G032000--Sobic005G111100 Sobic004G032000--Sobic001G128400 Sobic009G223300 Sobic009G223300 Sobic004G032000--Sobic009G223300 Sobic009G191200 Sobic009G191200 Sobic004G032000--Sobic009G191200 Sobic008G135000 Sobic008G135000 Sobic004G032000--Sobic008G135000 Sobic003G109600 Sobic003G109600 Sobic004G032000--Sobic003G109600 Sobic005G050500 Sobic005G050500 Sobic004G032000--Sobic005G050500 Sobic001G294000--Sobic006G150600 Sobic003G124800 Sobic003G124800 Sobic001G294000--Sobic003G124800 Sobic009G198500 Sobic009G198500 Sobic001G294000--Sobic009G198500 Sobic001G294000--Sobic008G132800 Sobic001G294000--Sobic010G065400 Sobic004G272300 Sobic004G272300 Sobic001G294000--Sobic004G272300 Sobic001G294000--Sobic009G016201 Sobic001G294000--Sobic004G066800 Sobic001G294000--Sobic002G078400 Sobic008G058300 Sobic008G058300 Sobic005G157200--Sobic008G058300 Sobic005G157200--Sobic001G331900 Sobic001G377800 Sobic001G377800 Sobic005G157200--Sobic001G377800 Sobic003G025200 Sobic003G025200 Sobic005G157200--Sobic003G025200 Sobic002G406500 Sobic002G406500 Sobic005G157200--Sobic002G406500 Sobic007G163700 Sobic007G163700 Sobic005G157200--Sobic007G163700 Sobic005G157200--Sobic010G029400 Sobic004G107600 Sobic004G107600 Sobic005G157200--Sobic004G107600 Sobic001G529000 Sobic001G529000 Sobic005G157200--Sobic001G529000 Sobic010G065400--Sobic002G078400 Sobic008G127500 Sobic008G127500 Sobic010G065400--Sobic008G127500 Sobic010G065400--Sobic008G132800 Sobic001G502200 Sobic001G502200 Sobic010G065400--Sobic001G502200 Sobic001G315500 Sobic001G315500 Sobic010G065400--Sobic001G315500 Sobic004G196300 Sobic004G196300 Sobic010G065400--Sobic004G196300 Sobic003G362400 Sobic003G362400 Sobic010G065400--Sobic003G362400 Sobic010G065400--Sobic005G111100 Sobic010G065400--Sobic009G198500 Sobic006G150600--Sobic003G124800 Sobic006G150600--Sobic001G294000 Sobic007G030700 Sobic007G030700 Sobic006G150600--Sobic007G030700 Sobic006G150600--Sobic001G529000 Sobic006G150600--Sobic009G198500 Sobic003G329800 Sobic003G329800 Sobic006G150600--Sobic003G329800 Sobic006G150600--Sobic008G058300 Sobic006G150600--Sobic003G362400 Sobic006G150600--Sobic008G132800 Sobic006G081100 Sobic006G081100 Sobic010G054200--Sobic006G081100 Sobic003G249700 Sobic003G249700 Sobic010G054200--Sobic003G249700 Sobic001G058900 Sobic001G058900 Sobic010G054200--Sobic001G058900 Sobic010G054200--Sobic009G223300 Sobic010G054200--Sobic003G129800 Sobic001G225700 Sobic001G225700 Sobic010G054200--Sobic001G225700 Sobic009G233400 Sobic009G233400 Sobic010G054200--Sobic009G233400 Sobic003G150000 Sobic003G150000 Sobic010G054200--Sobic003G150000 Sobic002G372400 Sobic002G372400 Sobic010G054200--Sobic002G372400 Sobic001G040300--Sobic007G163700 Sobic001G083200 Sobic001G083200 Sobic001G040300--Sobic001G083200 Sobic003G024800 Sobic003G024800 Sobic001G040300--Sobic003G024800 Sobic001G040300--Sobic008G138600 Sobic006G143500 Sobic006G143500 Sobic001G040300--Sobic006G143500 Sobic001G230900 Sobic001G230900 Sobic001G040300--Sobic001G230900 Sobic001G040300--Sobic001G517600 Sobic001G040300--Sobic004G032000 Sobic002G353500 Sobic002G353500 Sobic001G040300--Sobic002G353500
Octagon: transcription factors


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