Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G152200.2
Synonym Sb08g020133
Functional annotation DC1 domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R7S1
Pfam PF03107
Panther DB PTHR13871 PTHR13871:SF51
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G16050 : Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40470.1 : DC1 domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025235
Brachypodium KQJ86004
Barley HORVU5Hr1G016600.2 , HORVU5Hr1G016600.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G071000 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G096300 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
3 Sobic.004G096100 expressed protein -
4 Sobic.007G014600 transferase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G205600 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.001G377000 auxin-repressed protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G023401 - -
8 Sobic.003G264901 - -
9 Sobic.007G179750 - -
10 Sobic.001G053900 nodulin, putative, expressed -
11 Sobic.006G172900 scarecrow, putative, expressed -
12 Sobic.001G293800 chloroplast beta-amylase(PubMedID : 26465154)@chloroplast beta-amylase(PubMedID : 26465154)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
13 Sobic.010G172200 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.003G108600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
15 Sobic.006G053700 ACT domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G189000 expressed protein -
17 Sobic.001G102300 homeobox domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G063200 zinc finger family protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G214000 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G081150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G152200 Sobic008G152200 Sobic007G071000 Sobic007G071000 Sobic008G152200--Sobic007G071000 Sobic004G096300 Sobic004G096300 Sobic008G152200--Sobic004G096300 Sobic004G096100 Sobic004G096100 Sobic008G152200--Sobic004G096100 Sobic007G014600 Sobic007G014600 Sobic008G152200--Sobic007G014600 Sobic009G205600 Sobic009G205600 Sobic008G152200--Sobic009G205600 Sobic001G377000 Sobic001G377000 Sobic008G152200--Sobic001G377000 Sobic009G023401 Sobic009G023401 Sobic008G152200--Sobic009G023401 Sobic003G264901 Sobic003G264901 Sobic008G152200--Sobic003G264901 Sobic007G179750 Sobic007G179750 Sobic008G152200--Sobic007G179750 Sobic007G071000--Sobic008G152200 Sobic007G071000--Sobic001G377000 Sobic007G071000--Sobic004G096300 Sobic007G071000--Sobic003G264901 Sobic010G172200 Sobic010G172200 Sobic007G071000--Sobic010G172200 Sobic001G293800 Sobic001G293800 Sobic007G071000--Sobic001G293800 Sobic003G153800 Sobic003G153800 Sobic007G071000--Sobic003G153800 Sobic007G071000--Sobic009G205600 Sobic001G053900 Sobic001G053900 Sobic007G071000--Sobic001G053900 Sobic004G096300--Sobic010G172200 Sobic004G096300--Sobic001G293800 Sobic004G096300--Sobic001G377000 Sobic009G213400 Sobic009G213400 Sobic004G096300--Sobic009G213400 Sobic004G096300--Sobic003G264901 Sobic006G053700 Sobic006G053700 Sobic004G096300--Sobic006G053700 Sobic004G096300--Sobic001G053900 Sobic004G096300--Sobic007G014600 Sobic004G096300--Sobic008G152200 Sobic001G102300 Sobic001G102300 Sobic004G096100--Sobic001G102300 Sobic002G001800 Sobic002G001800 Sobic004G096100--Sobic002G001800 Sobic004G096100--Sobic008G152200 Sobic002G371900 Sobic002G371900 Sobic004G096100--Sobic002G371900 Sobic006G279400 Sobic006G279400 Sobic004G096100--Sobic006G279400 Sobic009G034600 Sobic009G034600 Sobic004G096100--Sobic009G034600 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic004G096100--Sobic002G281000 Sobic001G452700 Sobic001G452700 Sobic004G096100--Sobic001G452700 Sobic007G191900 Sobic007G191900 Sobic004G096100--Sobic007G191900 Sobic002G271600 Sobic002G271600 Sobic007G014600--Sobic002G271600 Sobic007G014600--Sobic004G096300 Sobic007G014600--Sobic006G053700 Sobic001G030500 Sobic001G030500 Sobic007G014600--Sobic001G030500 Sobic002G209100 Sobic002G209100 Sobic007G014600--Sobic002G209100 Sobic007G014600--Sobic009G205600 Sobic003G255100 Sobic003G255100 Sobic007G014600--Sobic003G255100 Sobic006G152500 Sobic006G152500 Sobic007G014600--Sobic006G152500 Sobic003G284300 Sobic003G284300 Sobic007G014600--Sobic003G284300 Sobic004G217700 Sobic004G217700 Sobic009G205600--Sobic004G217700 Sobic003G402200 Sobic003G402200 Sobic009G205600--Sobic003G402200 Sobic009G205600--Sobic002G271600 Sobic001G410450 Sobic001G410450 Sobic009G205600--Sobic001G410450 Sobic009G205600--Sobic007G014600 Sobic004G195800 Sobic004G195800 Sobic009G205600--Sobic004G195800 Sobic009G205600--Sobic002G209100 Sobic006G060800 Sobic006G060800 Sobic009G205600--Sobic006G060800 Sobic004G187300 Sobic004G187300 Sobic009G205600--Sobic004G187300 Sobic001G191200 Sobic001G191200 Sobic001G377000--Sobic001G191200 Sobic001G377000--Sobic009G213400 Sobic001G377000--Sobic004G096300 Sobic003G406700 Sobic003G406700 Sobic001G377000--Sobic003G406700 Sobic007G148200 Sobic007G148200 Sobic001G377000--Sobic007G148200 Sobic001G377000--Sobic001G293800 Sobic001G377000--Sobic007G071000 Sobic001G377000--Sobic010G172200 Sobic001G377000--Sobic003G264901 Sobic009G189000 Sobic009G189000 Sobic009G023401--Sobic009G189000 Sobic002G362100 Sobic002G362100 Sobic009G023401--Sobic002G362100 Sobic010G063200 Sobic010G063200 Sobic009G023401--Sobic010G063200 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic009G023401--Sobic001G404500 Sobic010G229450 Sobic010G229450 Sobic009G023401--Sobic010G229450 Sobic009G023401--Sobic006G060800 Sobic009G023401--Sobic008G152200 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic009G023401--Sobic004G063200 Sobic001G351400 Sobic001G351400 Sobic009G023401--Sobic001G351400 Sobic003G264901--Sobic004G096300 Sobic003G264901--Sobic010G172200 Sobic003G264901--Sobic001G293800 Sobic003G264901--Sobic006G053700 Sobic003G264901--Sobic007G071000 Sobic003G264901--Sobic001G377000 Sobic003G264901--Sobic009G205600 Sobic003G264901--Sobic003G153800 Sobic003G264901--Sobic001G053900 Sobic001G093600 Sobic001G093600 Sobic007G179750--Sobic001G093600 Sobic006G273000 Sobic006G273000 Sobic007G179750--Sobic006G273000 Sobic003G107300 Sobic003G107300 Sobic007G179750--Sobic003G107300 Sobic007G179750--Sobic007G014600 Sobic001G005500 Sobic001G005500 Sobic007G179750--Sobic001G005500 Sobic008G101500 Sobic008G101500 Sobic007G179750--Sobic008G101500 Sobic010G246600 Sobic010G246600 Sobic007G179750--Sobic010G246600 Sobic007G179750--Sobic007G191900 Sobic007G179750--Sobic008G152200
Octagon: transcription factors


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