Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G184300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt Q8LK00 , A0A1B6PEG2
Pfam -
Panther DB PTHR33087
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g52960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G061500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G270600 generative cell specific-1, putative, expressed -
3 Sobic.007G060400 - -
4 Sobic.003G091600 expressed protein -
5 Sobic.001G444900 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G027400 expressed protein -
7 Sobic.006G172400 expressed protein -
8 Sobic.001G003400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G071700 expressed protein -
10 Sobic.003G079532 - -
11 Sobic.005G209600 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
12 Sobic.004G014900 csAtPR5, putative, expressed -
13 Sobic.001G408001 - -
14 Sobic.004G288000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G336800 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G136400 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
17 Sobic.001G257400 mps one binder kinase activator-like 1A, putative, expressed K06685: MOB1, MOB kinase activator 1
18 Sobic.001G220500 CK1_CaseinKinase_1.9 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
19 Sobic.008G023801 - -
20 Sobic.002G284500 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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