Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G090800.1
Synonym Sb09g008890
Functional annotation CRAL/TRIO domain containing protein, expressed
UniProt C5YVC5
Pfam PF00650
Panther DB PTHR10174 PTHR10174:SF143
NCBI CDD KOG1470; Phosphatidylinositol transfer protein PDR16 and related proteins
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G08690 : Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g18470.1 : CRAL/TRIO domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G090800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G170400 chalcone synthase, putative, expressed -
2 Sobic.003G045501 - -
3 Sobic.004G064000 WAX2, putative, expressed -
4 Sobic.001G341001 - -
5 Sobic.003G022200 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G041400 PAPA-1-like conserved region family protein, expressed -
7 Sobic.004G329800 BHLH transcription factor, putative, expressed -
8 Sobic.007G078300 serine/threonine-protein kinase HT1, putative, expressed -
9 Sobic.005G085400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed -
10 Sobic.001G480550 - -
11 Sobic.001G166401 - -
12 Sobic.006G003951 - -
13 Sobic.001G394100 - -
14 Sobic.010G021200 GAGA-binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G367700 rhythmically expressed gene 2 protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G042400 expressed protein -
17 Sobic.004G003000 ribosomal protein L6, putative, expressed -
18 Sobic.001G039500 protein kinase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G090100 OsSCP28 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
20 Sobic.010G152200 avr9/Cf-9 rapidly elicited protein 194, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G090800 Sobic009G090800 Sobic007G170400 Sobic007G170400 Sobic009G090800--Sobic007G170400 Sobic003G045501 Sobic003G045501 Sobic009G090800--Sobic003G045501 Sobic004G064000 Sobic004G064000 Sobic009G090800--Sobic004G064000 Sobic001G341001 Sobic001G341001 Sobic009G090800--Sobic001G341001 Sobic003G022200 Sobic003G022200 Sobic009G090800--Sobic003G022200 Sobic001G041400 Sobic001G041400 Sobic009G090800--Sobic001G041400 Sobic004G329800 Sobic004G329800 Sobic009G090800--Sobic004G329800 Sobic007G078300 Sobic007G078300 Sobic009G090800--Sobic007G078300 Sobic005G085400 Sobic005G085400 Sobic009G090800--Sobic005G085400 Sobic001G351300 Sobic001G351300 Sobic007G170400--Sobic001G351300 Sobic003G077200 Sobic003G077200 Sobic007G170400--Sobic003G077200 Sobic001G262000 Sobic001G262000 Sobic007G170400--Sobic001G262000 Sobic007G170400--Sobic009G090800 Sobic005G210100 Sobic005G210100 Sobic007G170400--Sobic005G210100 Sobic007G090442 Sobic007G090442 Sobic007G170400--Sobic007G090442 Sobic006G180900 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Octagon: transcription factors


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