Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G226100.1
Synonym Sb09g027940
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P9X1
Pfam PF14226
Panther DB PTHR10209 PTHR10209:SF216
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13400 : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g48230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036557 , Zm00025a044499
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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FPKM plot


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1 Sobic.001G215300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G021500 CESA5 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
3 Sobic.003G042100 MAR-binding filament-like protein 1, putative, expressed -
4 Sobic.002G124100 - -
5 Sobic.008G008500 protein phosphatase 2c, putative, expressed -
6 Sobic.004G243400 copper methylamine oxidase precursor, putative, expressed K00276: AOC3, AOC2, primary-amine oxidase
7 Sobic.007G090415 - -
8 Sobic.003G165800 UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl-pyrophosphor yl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase, putative, expressed K02563: UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl-(pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase
9 Sobic.004G109000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@chalcone isomerase 3, putative, expressed -
10 Sobic.002G272400 expressed protein -
11 Sobic.001G036800 AP2 domain containing protein, expressed K09284: AP2-like factor, euAP2 lineage
12 Sobic.005G022800 GTP binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G448600 GTP-binding protein, putative, expressed K03978: GTP-binding protein
14 Sobic.002G141900 -(PubMedID : 26976818)@Citrate transporter protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G226200 expressed protein -
16 Sobic.009G226250 - -
17 Sobic.005G141000 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G142400 RIO1 family protein, expressed -
19 Sobic.006G249100 expressed protein -
20 Sobic.008G171100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G226100 Sobic009G226100 Sobic001G215300 Sobic001G215300 Sobic009G226100--Sobic001G215300 Sobic001G021500 Sobic001G021500 Sobic009G226100--Sobic001G021500 Sobic003G042100 Sobic003G042100 Sobic009G226100--Sobic003G042100 Sobic002G124100 Sobic002G124100 Sobic009G226100--Sobic002G124100 Sobic008G008500 Sobic008G008500 Sobic009G226100--Sobic008G008500 Sobic004G243400 Sobic004G243400 Sobic009G226100--Sobic004G243400 Sobic007G090415 Sobic007G090415 Sobic009G226100--Sobic007G090415 Sobic003G165800 Sobic003G165800 Sobic009G226100--Sobic003G165800 Sobic004G109000 Sobic004G109000 Sobic009G226100--Sobic004G109000 Sobic001G215300--Sobic004G109000 Sobic001G142400 Sobic001G142400 Sobic001G215300--Sobic001G142400 Sobic002G064400 Sobic002G064400 Sobic001G215300--Sobic002G064400 Sobic002G190100 Sobic002G190100 Sobic001G215300--Sobic002G190100 Sobic008G130700 Sobic008G130700 Sobic001G215300--Sobic008G130700 Sobic001G236800 Sobic001G236800 Sobic001G215300--Sobic001G236800 Sobic001G188600 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Octagon: transcription factors


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