Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G019200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YHV4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G094150 - -
2 Sobic.004G100000 expressed protein -
3 Sobic.008G005900 nodulin, putative, expressed -
4 Sobic.006G049200 violaxanthin de-epoxidase, putative, expressed K09839: VDE, violaxanthin de-epoxidase
5 Sobic.003G080000 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
6 Sobic.001G087800 expressed protein -
7 Sobic.006G128500 osFTL6 FT-Like6 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
8 Sobic.001G470700 - -
9 Sobic.005G173100 - -
10 Sobic.004G107500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@potassium channel KAT1, putative, expressed -
11 Sobic.004G126050 - -
12 Sobic.008G093300 - -
13 Sobic.008G086700 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G250000 OsMADS57 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
15 Sobic.004G126100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
17 Sobic.008G145000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
18 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
19 Sobic.003G139700 -(PubMedID : 26465154)@IF, putative, expressed -
20 Sobic.001G255866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G019200 Sobic010G019200 Sobic008G094150 Sobic008G094150 Sobic010G019200--Sobic008G094150 Sobic004G100000 Sobic004G100000 Sobic010G019200--Sobic004G100000 Sobic008G005900 Sobic008G005900 Sobic010G019200--Sobic008G005900 Sobic006G049200 Sobic006G049200 Sobic010G019200--Sobic006G049200 Sobic003G080000 Sobic003G080000 Sobic010G019200--Sobic003G080000 Sobic001G087800 Sobic001G087800 Sobic010G019200--Sobic001G087800 Sobic006G128500 Sobic006G128500 Sobic010G019200--Sobic006G128500 Sobic001G470700 Sobic001G470700 Sobic010G019200--Sobic001G470700 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic010G019200--Sobic005G173100 Sobic008G094150--Sobic010G019200 Sobic008G094150--Sobic004G100000 Sobic008G094150--Sobic008G005900 Sobic008G094150--Sobic001G087800 Sobic004G023600 Sobic004G023600 Sobic008G094150--Sobic004G023600 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic008G094150--Sobic001G300301 Sobic001G126500 Sobic001G126500 Sobic008G094150--Sobic001G126500 Sobic004G250000 Sobic004G250000 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Octagon: transcription factors


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