Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G080500.1
Synonym Sb10g006990
Functional annotation SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed
UniProt C5Z6F5
Pfam PF03492
Panther DB PTHR31009 PTHR31009:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008168; methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G38020 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20920.1 : SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G331900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G080500 Sobic010G080500 Sobic003G018600 Sobic003G018600 Sobic010G080500--Sobic003G018600 Sobic001G377800 Sobic001G377800 Sobic010G080500--Sobic001G377800 Sobic009G088100 Sobic009G088100 Sobic010G080500--Sobic009G088100 Sobic001G505500 Sobic001G505500 Sobic010G080500--Sobic001G505500 Sobic002G406500 Sobic002G406500 Sobic010G080500--Sobic002G406500 Sobic008G132700 Sobic008G132700 Sobic010G080500--Sobic008G132700 Sobic001G418900 Sobic001G418900 Sobic010G080500--Sobic001G418900 Sobic007G009100 Sobic007G009100 Sobic010G080500--Sobic007G009100 Sobic002G392800 Sobic002G392800 Sobic010G080500--Sobic002G392800 Sobic002G286900 Sobic002G286900 Sobic003G018600--Sobic002G286900 Sobic006G115000 Sobic006G115000 Sobic003G018600--Sobic006G115000 Sobic009G166500 Sobic009G166500 Sobic003G018600--Sobic009G166500 Sobic003G018600--Sobic001G377800 Sobic005G110800 Sobic005G110800 Sobic003G018600--Sobic005G110800 Sobic009G050300 Sobic009G050300 Sobic003G018600--Sobic009G050300 Sobic006G137100 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Octagon: transcription factors


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