Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G095500.1
Synonym
Functional annotation NHL repeat-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A194YJ84
Pfam -
Panther DB PTHR13833 PTHR13833:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g12660.1 : NHL repeat-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042617 , Zm00025a022015 , Zm00025a056831
Brachypodium KQK16803 , KQJ84005 , PNT76152
Barley HORVU2Hr1G096700.1 , HORVU7Hr1G038860.2 , HORVU7Hr1G038860.1 , HORVU7Hr1G038860.3 , HORVU7Hr1G038860.4 , HORVU6Hr1G076130.1 , HORVU6Hr1G076130.3 , HORVU6Hr1G076130.2 , HORVU6Hr1G076130.5 , HORVU6Hr1G076130.4
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G095500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G207300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@calvin cycle protein CP12, putative, expressed -
2 Sobic.002G175550 - -
3 Sobic.003G221300 - -
4 Sobic.005G097700 - -
5 Sobic.009G125500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.007G085350 - -
7 Sobic.004G110300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G232000 thioesterase family protein, putative, expressed K17362: acyl-coenzyme A thioesterase 13
9 Sobic.004G066000 expressed protein -
10 Sobic.010G158100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G198900 expressed protein -
12 Sobic.007G131900 expressed protein -
13 Sobic.010G153532 - -
14 Sobic.007G156101 - -
15 Sobic.002G004400 expressed protein -
16 Sobic.005G061400 expressed protein -
17 Sobic.001G017900 FAD binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G163700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K16189: phytochrome-interacting factor 4
19 Sobic.004G074200 abhydrolase domain-containing protein FAM108C1, putative, expressed -
20 Sobic.003G337100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G095500 Sobic010G095500 Sobic007G207300 Sobic007G207300 Sobic010G095500--Sobic007G207300 Sobic002G175550 Sobic002G175550 Sobic010G095500--Sobic002G175550 Sobic003G221300 Sobic003G221300 Sobic010G095500--Sobic003G221300 Sobic005G097700 Sobic005G097700 Sobic010G095500--Sobic005G097700 Sobic009G125500 Sobic009G125500 Sobic010G095500--Sobic009G125500 Sobic007G085350 Sobic007G085350 Sobic010G095500--Sobic007G085350 Sobic004G110300 Sobic004G110300 Sobic010G095500--Sobic004G110300 Sobic005G232000 Sobic005G232000 Sobic010G095500--Sobic005G232000 Sobic004G066000 Sobic004G066000 Sobic010G095500--Sobic004G066000 Sobic010G258100 Sobic010G258100 Sobic007G207300--Sobic010G258100 Sobic007G207300--Sobic010G095500 Sobic010G158100 Sobic010G158100 Sobic007G207300--Sobic010G158100 Sobic007G207300--Sobic005G232000 Sobic002G326050 Sobic002G326050 Sobic007G207300--Sobic002G326050 Sobic010G158766 Sobic010G158766 Sobic007G207300--Sobic010G158766 Sobic007G131900 Sobic007G131900 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Octagon: transcription factors


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