Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G240100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YL33
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G090401 - -
2 Sobic.002G212500 expressed protein -
3 Sobic.008G027000 rp1, putative, expressed -
4 Sobic.009G009100 - -
5 Sobic.005G175400 - -
6 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
7 Sobic.008G068500 - -
8 Sobic.009G220500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G020000 - -
10 Sobic.004G341900 lecithine cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.001G290000 enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed K05605: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase
12 Sobic.001G415600 - -
13 Sobic.009G161550 - -
14 Sobic.005G182000 - -
15 Sobic.003G019100 KIN, antigenic determinant of recA protein, putative, expressed K13102: DNA/RNA-binding protein KIN17
16 Sobic.003G176500 - -
17 Sobic.002G033300 expressed protein -
18 Sobic.008G098500 HD domain containing protein 2, putative, expressed -
19 Sobic.010G240001 - -
20 Sobic.007G178700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G240100 Sobic010G240100 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic010G240100--Sobic005G090401 Sobic002G212500 Sobic002G212500 Sobic010G240100--Sobic002G212500 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic010G240100--Sobic008G027000 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic010G240100--Sobic009G009100 Sobic005G175400 Sobic005G175400 Sobic010G240100--Sobic005G175400 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic010G240100--Sobic005G154850 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic010G240100--Sobic008G068500 Sobic009G220500 Sobic009G220500 Sobic010G240100--Sobic009G220500 Sobic003G020000 Sobic003G020000 Sobic010G240100--Sobic003G020000 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G090401--Sobic005G032800 Sobic002G212500--Sobic009G220500 Sobic006G036566 Sobic006G036566 Sobic002G212500--Sobic006G036566 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic002G212500--Sobic010G239600 Sobic002G033300 Sobic002G033300 Sobic002G212500--Sobic002G033300 Sobic002G212500--Sobic010G240100 Sobic009G003300 Sobic009G003300 Sobic002G212500--Sobic009G003300 Sobic002G124600 Sobic002G124600 Sobic002G212500--Sobic002G124600 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic002G212500--Sobic002G169633 Sobic002G212500--Sobic005G032800 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic008G027000--Sobic001G272532 Sobic008G027000--Sobic003G020000 Sobic008G027000--Sobic002G173000 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic008G027000--Sobic009G104201 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic008G027000--Sobic010G225226 Sobic008G026900 Sobic008G026900 Sobic008G027000--Sobic008G026900 Sobic008G027000--Sobic005G090401 Sobic008G027000--Sobic004G007100 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic008G027000--Sobic003G056100 Sobic009G009100--Sobic008G068500 Sobic009G009100--Sobic005G154850 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic009G009100--Sobic006G105400 Sobic003G080400 Sobic003G080400 Sobic009G009100--Sobic003G080400 Sobic008G137400 Sobic008G137400 Sobic009G009100--Sobic008G137400 Sobic003G028600 Sobic003G028600 Sobic009G009100--Sobic003G028600 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic009G009100--Sobic002G154100 Sobic009G009100--Sobic005G090401 Sobic005G225800 Sobic005G225800 Sobic009G009100--Sobic005G225800 Sobic005G175400--Sobic010G240100 Sobic005G175400--Sobic002G212500 Sobic001G422600 Sobic001G422600 Sobic005G175400--Sobic001G422600 Sobic010G220700 Sobic010G220700 Sobic005G175400--Sobic010G220700 Sobic005G175400--Sobic005G090401 Sobic002G005800 Sobic002G005800 Sobic005G175400--Sobic002G005800 Sobic004G053800 Sobic004G053800 Sobic005G175400--Sobic004G053800 Sobic005G175400--Sobic006G036566 Sobic005G175400--Sobic002G033300 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic009G220500--Sobic002G212500 Sobic009G220500--Sobic010G239600 Sobic009G220500--Sobic006G036566 Sobic010G112000 Sobic010G112000 Sobic009G220500--Sobic010G112000 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic009G220500--Sobic009G221000 Sobic007G183400 Sobic007G183400 Sobic009G220500--Sobic007G183400 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic009G220500--Sobic009G097200 Sobic009G220500--Sobic002G169633 Sobic004G034900 Sobic004G034900 Sobic009G220500--Sobic004G034900 Sobic003G020000--Sobic009G104201 Sobic003G020000--Sobic010G225226 Sobic003G020000--Sobic008G027000 Sobic003G020000--Sobic004G007100 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic003G020000--Sobic003G372700 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic003G020000--Sobic003G087400 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G020000--Sobic002G006900 Sobic003G020000--Sobic007G178700 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G020000--Sobic001G474600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.