Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G199700.1
Synonym Sb01g017620
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WWC2
Pfam -
Panther DB PTHR34558 PTHR34558:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g36360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT67675
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G241500 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
2 Sobic.007G072200 - -
3 Sobic.003G289300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G040950 - -
5 Sobic.008G119100 - -
6 Sobic.003G339400 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
7 Sobic.010G051900 expressed protein -
8 Sobic.008G005200 PMR5, putative, expressed -
9 Sobic.002G076450 - -
10 Sobic.002G267300 expressed protein -
11 Sobic.006G094000 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
12 Sobic.009G037600 RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G219900 NB-ARC domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G494350 - -
15 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
16 Sobic.009G240300 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G157800 - -
18 Sobic.001G423633 - -
19 Sobic.007G119400 expressed protein -
20 Sobic.001G437600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G199700 Sobic001G199700 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic001G199700--Sobic001G241500 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic001G199700--Sobic007G072200 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic001G199700--Sobic003G289300 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic001G199700--Sobic005G040950 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic001G199700--Sobic008G119100 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic001G199700--Sobic003G339400 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic001G199700--Sobic010G051900 Sobic008G005200 Sobic008G005200 Sobic001G199700--Sobic008G005200 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic001G199700--Sobic002G076450 Sobic001G241500--Sobic005G040950 Sobic001G241500--Sobic003G289300 Sobic001G241500--Sobic007G072200 Sobic001G241500--Sobic010G051900 Sobic001G241500--Sobic003G339400 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic001G241500--Sobic001G494350 Sobic005G106900 Sobic005G106900 Sobic001G241500--Sobic005G106900 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic001G241500--Sobic003G157800 Sobic005G219900 Sobic005G219900 Sobic001G241500--Sobic005G219900 Sobic007G072200--Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic003G339400 Sobic007G072200--Sobic003G289300 Sobic007G072200--Sobic005G040950 Sobic004G338600 Sobic004G338600 Sobic007G072200--Sobic004G338600 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic007G072200--Sobic002G076200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic007G072200--Sobic009G240300 Sobic007G072200--Sobic001G494350 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic007G072200--Sobic005G219800 Sobic003G289300--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic003G339400 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic003G289300--Sobic007G119400 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic005G219800 Sobic003G289300--Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic002G076200 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic003G289300 Sobic005G040950--Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic001G437600 Sobic005G040950--Sobic001G241500 Sobic005G040950--Sobic007G119400 Sobic005G040950--Sobic002G076200 Sobic005G040950--Sobic005G219800 Sobic005G040950--Sobic001G494350 Sobic008G119100--Sobic002G076450 Sobic008G119100--Sobic010G051900 Sobic001G524900 Sobic001G524900 Sobic008G119100--Sobic001G524900 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic008G119100--Sobic001G367900 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic008G119100--Sobic003G331200 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic008G119100--Sobic003G092150 Sobic008G119100--Sobic005G040950 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic008G119100--Sobic009G047033 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic008G119100--Sobic007G226000 Sobic003G339400--Sobic005G219800 Sobic003G339400--Sobic009G258200 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic003G289300 Sobic003G339400--Sobic007G119400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic003G339400--Sobic008G045900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic003G339400--Sobic009G142600 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic005G040950 Sobic010G051900--Sobic005G040950 Sobic010G051900--Sobic008G119100 Sobic010G051900--Sobic002G076450 Sobic010G051900--Sobic009G047033 Sobic010G051600 Sobic010G051600 Sobic010G051900--Sobic010G051600 Sobic010G051900--Sobic003G289300 Sobic010G051900--Sobic001G241500 Sobic010G051900--Sobic003G157800 Sobic010G051900--Sobic001G524900 Sobic008G016600 Sobic008G016600 Sobic008G005200--Sobic008G016600 Sobic010G189900 Sobic010G189900 Sobic008G005200--Sobic010G189900 Sobic006G241000 Sobic006G241000 Sobic008G005200--Sobic006G241000 Sobic008G005200--Sobic008G119100 Sobic008G005200--Sobic001G241500 Sobic008G005200--Sobic005G040950 Sobic008G005200--Sobic003G289300 Sobic008G005200--Sobic010G051900 Sobic001G423633 Sobic001G423633 Sobic008G005200--Sobic001G423633 Sobic002G076450--Sobic008G119100 Sobic002G076450--Sobic010G051900 Sobic002G076450--Sobic009G047033 Sobic005G201100 Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic001G524900 Sobic002G076450--Sobic005G040950 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic003G092150 Sobic002G076450--Sobic003G289300
Octagon: transcription factors


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