Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G210700.1,Sobic.001G210700.2
Synonym Sb01g018630
Functional annotation HNH endonuclease domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S6N2 , A0A1Z5S6N5
Pfam -
Panther DB PTHR33427
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18680 : HNH endonuclease domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g18890.1 : HNH endonuclease domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002582 , Zm00025a017959
Brachypodium KQJ96532
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G050100 ATKINESIN-13A/KINESIN-13A, putative, expressed K11091: U1 small nuclear ribonucleoprotein A
2 Sobic.002G396200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptide deformylase, putative, expressed K01462: PDF, peptide deformylase
3 Sobic.005G108801 - -
4 Sobic.006G177100 expressed protein K03671: thioredoxin 1
5 Sobic.009G225900 60S ribosomal protein L35a-3, putative, expressed K02917: RP-L35Ae, large subunit ribosomal protein L35Ae
6 Sobic.007G216600 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
7 Sobic.001G171500 presenilin, putative, expressed K04505: PSEN1, presenilin 1
8 Sobic.004G207700 expressed protein -
9 Sobic.009G228300 50S ribosomal protein L21, chloroplast precursor, putative, expressed K02888: RP-L21, MRPL21, large subunit ribosomal protein L21
10 Sobic.002G219800 expressed protein -
11 Sobic.001G157500 expressed protein -
12 Sobic.003G216700 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
13 Sobic.004G107900 bZIP transcription factor family protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G034600 expressed protein -
15 Sobic.001G216701 - -
16 Sobic.010G123700 expressed protein -
17 Sobic.004G177100 RNA methyltransferase protein, putative, expressed K15430: TRM11, tRNA (guanine10-N2)-methyltransferase
18 Sobic.003G407800 nucleolar protein NOP5-1, putative, expressed K14565: nucleolar protein 58
19 Sobic.007G184400 60S ribosomal protein L7, putative, expressed K02937: RP-L7e, large subunit ribosomal protein L7e
20 Sobic.010G103900 ribosomal protein L51, putative, expressed K17424: large subunit ribosomal protein L43


Gene co-expression network
sample Sobic001G210700 Sobic001G210700 Sobic009G050100 Sobic009G050100 Sobic001G210700--Sobic009G050100 Sobic002G396200 Sobic002G396200 Sobic001G210700--Sobic002G396200 Sobic005G108801 Sobic005G108801 Sobic001G210700--Sobic005G108801 Sobic006G177100 Sobic006G177100 Sobic001G210700--Sobic006G177100 Sobic009G225900 Sobic009G225900 Sobic001G210700--Sobic009G225900 Sobic007G216600 Sobic007G216600 Sobic001G210700--Sobic007G216600 Sobic001G171500 Sobic001G171500 Sobic001G210700--Sobic001G171500 Sobic004G207700 Sobic004G207700 Sobic001G210700--Sobic004G207700 Sobic009G228300 Sobic009G228300 Sobic001G210700--Sobic009G228300 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic009G050100--Sobic003G284500 Sobic001G150800 Sobic001G150800 Sobic009G050100--Sobic001G150800 Sobic003G128500 Sobic003G128500 Sobic009G050100--Sobic003G128500 Sobic009G050100--Sobic006G177100 Sobic002G270100 Sobic002G270100 Sobic009G050100--Sobic002G270100 Sobic010G097400 Sobic010G097400 Sobic009G050100--Sobic010G097400 Sobic003G377200 Sobic003G377200 Sobic009G050100--Sobic003G377200 Sobic003G148500 Sobic003G148500 Sobic009G050100--Sobic003G148500 Sobic009G050100--Sobic001G210700 Sobic006G178800 Sobic006G178800 Sobic002G396200--Sobic006G178800 Sobic006G157800 Sobic006G157800 Sobic002G396200--Sobic006G157800 Sobic010G207700 Sobic010G207700 Sobic002G396200--Sobic010G207700 Sobic009G055900 Sobic009G055900 Sobic002G396200--Sobic009G055900 Sobic004G243400 Sobic004G243400 Sobic002G396200--Sobic004G243400 Sobic009G010900 Sobic009G010900 Sobic002G396200--Sobic009G010900 Sobic003G223100 Sobic003G223100 Sobic002G396200--Sobic003G223100 Sobic009G157000 Sobic009G157000 Sobic002G396200--Sobic009G157000 Sobic003G333000 Sobic003G333000 Sobic002G396200--Sobic003G333000 Sobic003G077300 Sobic003G077300 Sobic005G108801--Sobic003G077300 Sobic002G394600 Sobic002G394600 Sobic005G108801--Sobic002G394600 Sobic004G198900 Sobic004G198900 Sobic005G108801--Sobic004G198900 Sobic004G343200 Sobic004G343200 Sobic005G108801--Sobic004G343200 Sobic007G217400 Sobic007G217400 Sobic005G108801--Sobic007G217400 Sobic007G134100 Sobic007G134100 Sobic005G108801--Sobic007G134100 Sobic003G199700 Sobic003G199700 Sobic005G108801--Sobic003G199700 Sobic005G120700 Sobic005G120700 Sobic005G108801--Sobic005G120700 Sobic006G245700 Sobic006G245700 Sobic005G108801--Sobic006G245700 Sobic006G177100--Sobic010G097400 Sobic002G339400 Sobic002G339400 Sobic006G177100--Sobic002G339400 Sobic004G288400 Sobic004G288400 Sobic006G177100--Sobic004G288400 Sobic002G366700 Sobic002G366700 Sobic006G177100--Sobic002G366700 Sobic010G014300 Sobic010G014300 Sobic006G177100--Sobic010G014300 Sobic006G177100--Sobic009G050100 Sobic001G494150 Sobic001G494150 Sobic006G177100--Sobic001G494150 Sobic006G177100--Sobic003G284500 Sobic006G258400 Sobic006G258400 Sobic006G177100--Sobic006G258400 Sobic006G018900 Sobic006G018900 Sobic009G225900--Sobic006G018900 Sobic009G225900--Sobic009G050100 Sobic009G225900--Sobic007G216600 Sobic004G249700 Sobic004G249700 Sobic009G225900--Sobic004G249700 Sobic009G225900--Sobic006G177100 Sobic004G107900 Sobic004G107900 Sobic009G225900--Sobic004G107900 Sobic004G244800 Sobic004G244800 Sobic009G225900--Sobic004G244800 Sobic001G462100 Sobic001G462100 Sobic009G225900--Sobic001G462100 Sobic001G239400 Sobic001G239400 Sobic009G225900--Sobic001G239400 Sobic007G073600 Sobic007G073600 Sobic007G216600--Sobic007G073600 Sobic010G163900 Sobic010G163900 Sobic007G216600--Sobic010G163900 Sobic007G009000 Sobic007G009000 Sobic007G216600--Sobic007G009000 Sobic009G036900 Sobic009G036900 Sobic007G216600--Sobic009G036900 Sobic001G030400 Sobic001G030400 Sobic007G216600--Sobic001G030400 Sobic007G216600--Sobic009G225900 Sobic002G219800 Sobic002G219800 Sobic007G216600--Sobic002G219800 Sobic001G397700 Sobic001G397700 Sobic007G216600--Sobic001G397700 Sobic010G095600 Sobic010G095600 Sobic007G216600--Sobic010G095600 Sobic004G018200 Sobic004G018200 Sobic001G171500--Sobic004G018200 Sobic002G372700 Sobic002G372700 Sobic001G171500--Sobic002G372700 Sobic004G210101 Sobic004G210101 Sobic001G171500--Sobic004G210101 Sobic002G427700 Sobic002G427700 Sobic001G171500--Sobic002G427700 Sobic004G339600 Sobic004G339600 Sobic001G171500--Sobic004G339600 Sobic007G019501 Sobic007G019501 Sobic001G171500--Sobic007G019501 Sobic004G172600 Sobic004G172600 Sobic001G171500--Sobic004G172600 Sobic009G077700 Sobic009G077700 Sobic001G171500--Sobic009G077700 Sobic002G259400 Sobic002G259400 Sobic001G171500--Sobic002G259400 Sobic004G207700--Sobic010G095600 Sobic006G211200 Sobic006G211200 Sobic004G207700--Sobic006G211200 Sobic004G268800 Sobic004G268800 Sobic004G207700--Sobic004G268800 Sobic001G040300 Sobic001G040300 Sobic004G207700--Sobic001G040300 Sobic004G207700--Sobic004G244800 Sobic008G172100 Sobic008G172100 Sobic004G207700--Sobic008G172100 Sobic001G172800 Sobic001G172800 Sobic004G207700--Sobic001G172800 Sobic001G162000 Sobic001G162000 Sobic004G207700--Sobic001G162000 Sobic002G353500 Sobic002G353500 Sobic004G207700--Sobic002G353500 Sobic001G072900 Sobic001G072900 Sobic009G228300--Sobic001G072900 Sobic009G228300--Sobic004G172600 Sobic005G034600 Sobic005G034600 Sobic009G228300--Sobic005G034600 Sobic003G054100 Sobic003G054100 Sobic009G228300--Sobic003G054100 Sobic001G267500 Sobic001G267500 Sobic009G228300--Sobic001G267500 Sobic001G312700 Sobic001G312700 Sobic009G228300--Sobic001G312700 Sobic010G018900 Sobic010G018900 Sobic009G228300--Sobic010G018900 Sobic007G130000 Sobic007G130000 Sobic009G228300--Sobic007G130000 Sobic004G076850 Sobic004G076850 Sobic009G228300--Sobic004G076850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.