Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G207700.1,Sobic.004G207700.2
Synonym Sb04g025320
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YRX5 , A0A194YQS5
Pfam -
Panther DB PTHR36709
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08580 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021256
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G207700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G095600 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G211200 expressed protein -
3 Sobic.004G268800 nodulin, putative, expressed -
4 Sobic.001G040300 expressed protein -
5 Sobic.004G244800 ribosomal protein, putative, expressed K02995: RP-S8e, small subunit ribosomal protein S8e
6 Sobic.008G172100 ribosomal protein, putative, expressed K02874: RP-L14, MRPL14, large subunit ribosomal protein L14
7 Sobic.001G172800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K09564: peptidyl-prolyl isomerase E (cyclophilin E)
8 Sobic.001G162000 prefoldin subunit, putative, expressed K09550: prefoldin subunit 4
9 Sobic.002G353500 ruvB-like 2, putative, expressed K11338: RUVBL2, RVB2, RuvB-like protein 2
10 Sobic.001G210700 HNH endonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G517600 ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed K02932: RP-L5e, large subunit ribosomal protein L5e
12 Sobic.001G371400 nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, putative, expressed K03626: EGD2, nascent polypeptide-associated complex subunit alpha
13 Sobic.007G163700 zinc finger protein 593, putative, expressed K14821: bud site selection protein 20
14 Sobic.002G411300 expressed protein -
15 Sobic.010G106200 signal recognition particle 9 kDa protein, putative, expressed K03109: signal recognition particle subunit SRP9
16 Sobic.010G163900 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G117000 expressed protein -
18 Sobic.004G271400 L11 domain containing ribosomal protein, putative, expressed K02870: RP-L12e, large subunit ribosomal protein L12e
19 Sobic.003G227000 DUF623 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G338966 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G207700 Sobic004G207700 Sobic010G095600 Sobic010G095600 Sobic004G207700--Sobic010G095600 Sobic006G211200 Sobic006G211200 Sobic004G207700--Sobic006G211200 Sobic004G268800 Sobic004G268800 Sobic004G207700--Sobic004G268800 Sobic001G040300 Sobic001G040300 Sobic004G207700--Sobic001G040300 Sobic004G244800 Sobic004G244800 Sobic004G207700--Sobic004G244800 Sobic008G172100 Sobic008G172100 Sobic004G207700--Sobic008G172100 Sobic001G172800 Sobic001G172800 Sobic004G207700--Sobic001G172800 Sobic001G162000 Sobic001G162000 Sobic004G207700--Sobic001G162000 Sobic002G353500 Sobic002G353500 Sobic004G207700--Sobic002G353500 Sobic003G357300 Sobic003G357300 Sobic010G095600--Sobic003G357300 Sobic010G095600--Sobic001G162000 Sobic004G271400 Sobic004G271400 Sobic010G095600--Sobic004G271400 Sobic001G389400 Sobic001G389400 Sobic010G095600--Sobic001G389400 Sobic003G344600 Sobic003G344600 Sobic010G095600--Sobic003G344600 Sobic007G018300 Sobic007G018300 Sobic010G095600--Sobic007G018300 Sobic003G322400 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Octagon: transcription factors


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