Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G278500.1
Synonym Sb01g027416
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S7Y2
Pfam PF00010
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22760 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g01530.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G099600 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
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10 Sobic.006G012200 flavin monooxygenase, putative, expressed K11816: indole-3-pyruvate monooxygenase
11 Sobic.006G117100 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
12 Sobic.009G225800 expressed protein -
13 Sobic.009G004950 - -
14 Sobic.002G381200 expressed protein -
15 Sobic.004G080300 -(PubMedID : 23108465)@MONOCULM 1, putative, expressed -
16 Sobic.007G058200 - -
17 Sobic.007G057300 - -
18 Sobic.004G120000 expansin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.009G204900 receptor-like protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.001G278300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G278500 Sobic001G278500 Sobic008G099600 Sobic008G099600 Sobic001G278500--Sobic008G099600 Sobic005G069000 Sobic005G069000 Sobic001G278500--Sobic005G069000 Sobic008G099232 Sobic008G099232 Sobic001G278500--Sobic008G099232 Sobic003G428800 Sobic003G428800 Sobic001G278500--Sobic003G428800 Sobic004G121900 Sobic004G121900 Sobic001G278500--Sobic004G121900 Sobic001G327900 Sobic001G327900 Sobic001G278500--Sobic001G327900 Sobic008G099300 Sobic008G099300 Sobic001G278500--Sobic008G099300 Sobic005G068900 Sobic005G068900 Sobic001G278500--Sobic005G068900 Sobic008G079800 Sobic008G079800 Sobic001G278500--Sobic008G079800 Sobic008G099600--Sobic001G278500 Sobic008G099600--Sobic005G069000 Sobic008G099600--Sobic001G327900 Sobic008G099600--Sobic008G099232 Sobic006G201700 Sobic006G201700 Sobic008G099600--Sobic006G201700 Sobic008G099600--Sobic008G099300 Sobic008G099600--Sobic003G428800 Sobic009G225800 Sobic009G225800 Sobic008G099600--Sobic009G225800 Sobic008G099600--Sobic008G079800 Sobic007G057300 Sobic007G057300 Sobic005G069000--Sobic007G057300 Sobic005G069000--Sobic003G428800 Sobic005G069000--Sobic001G278500 Sobic005G069000--Sobic009G225800 Sobic005G069000--Sobic008G099600 Sobic005G069000--Sobic005G068900 Sobic008G008801 Sobic008G008801 Sobic005G069000--Sobic008G008801 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic005G069000--Sobic007G015100 Sobic005G069000--Sobic008G099300 Sobic008G099232--Sobic008G099300 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic008G099232--Sobic005G226350 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic008G099232--Sobic005G226400 Sobic005G217766 Sobic005G217766 Sobic008G099232--Sobic005G217766 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic008G099232--Sobic010G128300 Sobic010G010000 Sobic010G010000 Sobic008G099232--Sobic010G010000 Sobic006G059800 Sobic006G059800 Sobic008G099232--Sobic006G059800 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic008G099232--Sobic002G111900 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic008G099232--Sobic001G506100 Sobic003G428800--Sobic005G069000 Sobic003G428800--Sobic007G057300 Sobic003G428800--Sobic008G008801 Sobic003G428800--Sobic004G121900 Sobic002G030650 Sobic002G030650 Sobic003G428800--Sobic002G030650 Sobic003G428800--Sobic008G099600 Sobic003G428800--Sobic001G278500 Sobic003G428800--Sobic007G015100 Sobic002G381200 Sobic002G381200 Sobic003G428800--Sobic002G381200 Sobic004G121900--Sobic007G057300 Sobic004G121900--Sobic008G079800 Sobic006G117100 Sobic006G117100 Sobic004G121900--Sobic006G117100 Sobic004G121900--Sobic008G099300 Sobic002G415000 Sobic002G415000 Sobic004G121900--Sobic002G415000 Sobic003G128800 Sobic003G128800 Sobic004G121900--Sobic003G128800 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic004G121900--Sobic004G306900 Sobic002G195600 Sobic002G195600 Sobic004G121900--Sobic002G195600 Sobic006G102300 Sobic006G102300 Sobic004G121900--Sobic006G102300 Sobic001G327900--Sobic008G099600 Sobic001G327900--Sobic001G278500 Sobic001G327900--Sobic005G069000 Sobic003G428300 Sobic003G428300 Sobic001G327900--Sobic003G428300 Sobic004G323900 Sobic004G323900 Sobic001G327900--Sobic004G323900 Sobic006G114600 Sobic006G114600 Sobic001G327900--Sobic006G114600 Sobic001G327900--Sobic008G079800 Sobic010G187500 Sobic010G187500 Sobic001G327900--Sobic010G187500 Sobic001G327900--Sobic003G428800 Sobic008G099300--Sobic008G099232 Sobic008G099300--Sobic005G217766 Sobic008G099300--Sobic002G111900 Sobic008G099300--Sobic009G225800 Sobic008G099300--Sobic010G010000 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic008G099300--Sobic007G220400 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic008G099300--Sobic009G065700 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic008G099300--Sobic001G414800 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic008G099300--Sobic004G119800 Sobic001G327200 Sobic001G327200 Sobic005G068900--Sobic001G327200 Sobic002G274600 Sobic002G274600 Sobic005G068900--Sobic002G274600 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic005G068900--Sobic006G171100 Sobic005G068900--Sobic005G069000 Sobic005G068900--Sobic007G057300 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic005G068900--Sobic001G153100 Sobic005G068900--Sobic009G225800 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic005G068900--Sobic009G136800 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic005G068900--Sobic001G348400 Sobic008G079800--Sobic009G225800 Sobic003G426200 Sobic003G426200 Sobic008G079800--Sobic003G426200 Sobic005G079100 Sobic005G079100 Sobic008G079800--Sobic005G079100 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic008G079800--Sobic003G167300 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic008G079800--Sobic005G046400 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic008G079800--Sobic001G499900 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic008G079800--Sobic003G441601 Sobic008G079800--Sobic007G220400 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic008G079800--Sobic006G205700
Octagon: transcription factors


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