Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G278300.2,Sobic.001G278300.3
Synonym Sb01g027411
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S7Y4
Pfam PF00010
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22760 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g01530.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003668
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G009300 expressed protein -
2 Sobic.004G120000 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.001G233100 - -
4 Sobic.003G046700 expressed protein -
5 Sobic.007G019900 expansin precursor, putative, expressed -
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10 Sobic.004G119900 expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.006G135500 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
12 Sobic.008G145900 FAD-binding and arabino-lactone oxidase domains containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G099232 - -
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15 Sobic.007G094100 OsWAK108 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.007G020200 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.005G226350 - -
18 Sobic.005G216500 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G080600 RCLEA2 - Root cap and Late embryogenesis related family protein precursor, putative, expressed -
20 Sobic.004G337950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G278300 Sobic001G278300 Sobic004G009300 Sobic004G009300 Sobic001G278300--Sobic004G009300 Sobic004G120000 Sobic004G120000 Sobic001G278300--Sobic004G120000 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic001G278300--Sobic001G233100 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic001G278300--Sobic003G046700 Sobic007G019900 Sobic007G019900 Sobic001G278300--Sobic007G019900 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G278300--Sobic005G226200 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic001G278300--Sobic009G004900 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic001G278300--Sobic009G018300 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic001G278300--Sobic006G171300 Sobic004G009300--Sobic009G018300 Sobic002G392300 Sobic002G392300 Sobic004G009300--Sobic002G392300 Sobic007G094100 Sobic007G094100 Sobic004G009300--Sobic007G094100 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic004G009300--Sobic004G337950 Sobic006G135500 Sobic006G135500 Sobic004G009300--Sobic006G135500 Sobic004G009300--Sobic003G046700 Sobic004G119900 Sobic004G119900 Sobic004G009300--Sobic004G119900 Sobic004G009300--Sobic001G233100 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic004G009300--Sobic001G521600 Sobic004G120000--Sobic009G004900 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic004G120000--Sobic010G128300 Sobic004G120000--Sobic004G119900 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic004G120000--Sobic005G226400 Sobic004G120000--Sobic001G233100 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic004G120000--Sobic002G063700 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic004G120000--Sobic005G226350 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G120000--Sobic009G136800 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic004G120000--Sobic005G134200 Sobic001G233100--Sobic009G004900 Sobic001G233100--Sobic009G018300 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic001G233100--Sobic001G506100 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic001G233100--Sobic007G097550 Sobic001G233100--Sobic004G119900 Sobic001G233100--Sobic010G128300 Sobic001G233100--Sobic005G226200 Sobic001G233100--Sobic005G226400 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G233100--Sobic002G392000 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic003G046700--Sobic002G334000 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic003G046700--Sobic010G269000 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic003G046700--Sobic004G008600 Sobic005G216500 Sobic005G216500 Sobic003G046700--Sobic005G216500 Sobic003G046700--Sobic005G226350 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic003G046700--Sobic007G220400 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic003G046700--Sobic010G191700 Sobic003G046700--Sobic009G018300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic003G046700--Sobic010G241900 Sobic007G019900--Sobic006G135500 Sobic008G145900 Sobic008G145900 Sobic007G019900--Sobic008G145900 Sobic001G238100 Sobic001G238100 Sobic007G019900--Sobic001G238100 Sobic010G139100 Sobic010G139100 Sobic007G019900--Sobic010G139100 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic007G019900--Sobic002G392100 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic007G019900--Sobic005G216700 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic007G019900--Sobic002G068000 Sobic009G032900 Sobic009G032900 Sobic007G019900--Sobic009G032900 Sobic007G019900--Sobic002G334000 Sobic005G226200--Sobic001G506100 Sobic005G226200--Sobic010G128300 Sobic005G226200--Sobic001G233100 Sobic005G226200--Sobic003G046700 Sobic005G226200--Sobic009G018300 Sobic005G226200--Sobic009G004900 Sobic005G226200--Sobic001G521600 Sobic005G226200--Sobic002G392000 Sobic005G226200--Sobic002G334000 Sobic009G004900--Sobic001G233100 Sobic009G004900--Sobic009G018300 Sobic009G004900--Sobic001G506100 Sobic009G004900--Sobic007G097550 Sobic009G004900--Sobic005G226400 Sobic009G004900--Sobic010G128300 Sobic009G004900--Sobic004G119900 Sobic009G004900--Sobic004G120000 Sobic002G409200 Sobic002G409200 Sobic009G004900--Sobic002G409200 Sobic009G018300--Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic001G233100 Sobic009G018300--Sobic001G506100 Sobic009G018300--Sobic009G004900 Sobic009G018300--Sobic003G046700 Sobic009G018300--Sobic001G521600 Sobic009G018300--Sobic004G337950 Sobic009G018300--Sobic004G009300 Sobic009G018300--Sobic010G269000 Sobic006G171300--Sobic007G094100 Sobic010G174100 Sobic010G174100 Sobic006G171300--Sobic010G174100 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic006G171300--Sobic010G115000 Sobic009G096300 Sobic009G096300 Sobic006G171300--Sobic009G096300 Sobic006G171300--Sobic004G009300 Sobic003G269900 Sobic003G269900 Sobic006G171300--Sobic003G269900 Sobic006G171300--Sobic010G139100 Sobic006G171300--Sobic002G392300 Sobic002G391200 Sobic002G391200 Sobic006G171300--Sobic002G391200
Octagon: transcription factors


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