Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G099232.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6R2
Pfam PF00635
Panther DB PTHR10809 PTHR10809:SF49
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005789; endoplasmic reticulum membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G60600 : vesicle associated protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17380.1 : protein kinase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G099300 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G226350 - -
3 Sobic.005G226400 RGH1A, putative, expressed -
4 Sobic.005G217766 - -
5 Sobic.010G128300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.010G010000 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G059800 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
8 Sobic.002G111900 receptor-like kinase, putative, expressed -
9 Sobic.001G506100 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.009G004900 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
11 Sobic.005G223700 RGH1A, putative, expressed -
12 Sobic.009G136800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
13 Sobic.009G225800 expressed protein -
14 Sobic.007G220400 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G392000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.010G191700 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.001G233100 - -
18 Sobic.006G171100 expansin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G391300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.002G063700 NB-ARC domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G099232 Sobic008G099232 Sobic008G099300 Sobic008G099300 Sobic008G099232--Sobic008G099300 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic008G099232--Sobic005G226350 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic008G099232--Sobic005G226400 Sobic005G217766 Sobic005G217766 Sobic008G099232--Sobic005G217766 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic008G099232--Sobic010G128300 Sobic010G010000 Sobic010G010000 Sobic008G099232--Sobic010G010000 Sobic006G059800 Sobic006G059800 Sobic008G099232--Sobic006G059800 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic008G099232--Sobic002G111900 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic008G099232--Sobic001G506100 Sobic008G099300--Sobic008G099232 Sobic008G099300--Sobic005G217766 Sobic008G099300--Sobic002G111900 Sobic009G225800 Sobic009G225800 Sobic008G099300--Sobic009G225800 Sobic008G099300--Sobic010G010000 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic008G099300--Sobic007G220400 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic008G099300--Sobic009G065700 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic008G099300--Sobic001G414800 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic008G099300--Sobic004G119800 Sobic005G226350--Sobic007G220400 Sobic005G226350--Sobic010G128300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic005G226350--Sobic010G241900 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic005G226350--Sobic010G269000 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic005G226350--Sobic010G191700 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic005G226350--Sobic005G134200 Sobic005G226350--Sobic002G111900 Sobic005G226350--Sobic005G226400 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic005G226350--Sobic004G008600 Sobic005G226400--Sobic005G134200 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic005G226400--Sobic009G136800 Sobic005G226400--Sobic010G128300 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic005G226400--Sobic002G391300 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic005G226400--Sobic006G171100 Sobic005G223700 Sobic005G223700 Sobic005G226400--Sobic005G223700 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic005G226400--Sobic006G047200 Sobic005G226400--Sobic005G226350 Sobic005G226400--Sobic010G010000 Sobic010G191600 Sobic010G191600 Sobic005G217766--Sobic010G191600 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic005G217766--Sobic002G391400 Sobic005G217766--Sobic002G111900 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic005G217766--Sobic006G205700 Sobic005G217766--Sobic001G414800 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic005G217766--Sobic007G206800 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic005G217766--Sobic003G441800 Sobic005G217766--Sobic010G191700 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic005G217766--Sobic004G106100 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic010G128300--Sobic002G392000 Sobic010G128300--Sobic010G241900 Sobic010G128300--Sobic010G191700 Sobic010G128300--Sobic002G391300 Sobic010G128300--Sobic005G226400 Sobic010G128300--Sobic005G226350 Sobic010G128300--Sobic005G134200 Sobic010G128300--Sobic009G136800 Sobic010G128300--Sobic007G220400 Sobic010G010000--Sobic006G171100 Sobic010G010000--Sobic002G111900 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic010G010000--Sobic003G441601 Sobic010G010000--Sobic002G391300 Sobic010G010000--Sobic009G136800 Sobic009G055300 Sobic009G055300 Sobic010G010000--Sobic009G055300 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic010G010000--Sobic002G289500 Sobic010G010000--Sobic005G226400 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic010G010000--Sobic002G063700 Sobic006G059800--Sobic002G111900 Sobic006G059800--Sobic006G047200 Sobic005G035900 Sobic005G035900 Sobic006G059800--Sobic005G035900 Sobic006G059800--Sobic002G391300 Sobic006G059800--Sobic002G392000 Sobic006G059800--Sobic010G010000 Sobic006G059800--Sobic010G191700 Sobic006G059800--Sobic006G171100 Sobic006G059800--Sobic010G241900 Sobic002G111900--Sobic010G191700 Sobic002G111900--Sobic002G391300 Sobic002G111900--Sobic003G441601 Sobic002G111900--Sobic007G220400 Sobic002G111900--Sobic010G241900 Sobic002G111900--Sobic010G010000 Sobic002G111900--Sobic006G171100 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic002G111900--Sobic005G046400 Sobic002G111900--Sobic006G059800 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic001G506100--Sobic009G018300 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic001G506100--Sobic001G233100 Sobic001G506100--Sobic010G128300 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic001G506100--Sobic009G004900 Sobic001G506100--Sobic002G392000 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic001G506100--Sobic007G097550 Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic001G506100--Sobic005G205400 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G506100--Sobic005G226200 Sobic001G506100--Sobic005G226400
Octagon: transcription factors


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