Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G012200.1
Synonym SUPER1, YUC5, Sb06g001210
Functional annotation flavin monooxygenase, putative, expressed
UniProt C5YBT6
Pfam PF13738
Panther DB PTHR23023 PTHR23023:SF83
NCBI CDD KOG1399; Flavin-containing monooxygenase
KEGG Orthology K11816; indole-3-pyruvate monooxygenase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G28720 : Flavin-binding monooxygenase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g03980.1 : flavin monooxygenase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045796 , Zm00025a055588 , Zm00025a012262 , Zm00025a013748
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G125560.2 , HORVU5Hr1G125560.1 , HORVU5Hr1G125560.3 , HORVU5Hr1G050630.3 , HORVU5Hr1G050630.2
Wheat TraesCS5B02G566700 , TraesCS2B02G010100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G117100 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
2 Sobic.001G278500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
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5 Sobic.007G058200 - -
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7 Sobic.005G069000 OsWAK124 - OsWAK receptor-like protein OsWAK-RLP, expressed -
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9 Sobic.004G178000 Decreased expression in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@OsRR2 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
10 Sobic.009G204900 receptor-like protein kinase, putative, expressed -
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14 Sobic.003G428300 Decreased expression in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@OsRR4 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
15 Sobic.008G099600 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
16 Sobic.008G099300 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G385700 - -
18 Sobic.007G192000 ACR5, putative, expressed -
19 Sobic.010G187500 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G287400 respiratory burst oxidase, putative, expressed K13447: respiratory burst oxidase


Gene co-expression network
sample Sobic006G012200 Sobic006G012200 Sobic006G117100 Sobic006G117100 Sobic006G012200--Sobic006G117100 Sobic001G278500 Sobic001G278500 Sobic006G012200--Sobic001G278500 Sobic004G121900 Sobic004G121900 Sobic006G012200--Sobic004G121900 Sobic003G405000 Sobic003G405000 Sobic006G012200--Sobic003G405000 Sobic007G058200 Sobic007G058200 Sobic006G012200--Sobic007G058200 Sobic006G190300 Sobic006G190300 Sobic006G012200--Sobic006G190300 Sobic005G069000 Sobic005G069000 Sobic006G012200--Sobic005G069000 Sobic005G196300 Sobic005G196300 Sobic006G012200--Sobic005G196300 Sobic004G178000 Sobic004G178000 Sobic006G012200--Sobic004G178000 Sobic001G514700 Sobic001G514700 Sobic006G117100--Sobic001G514700 Sobic003G426200 Sobic003G426200 Sobic006G117100--Sobic003G426200 Sobic005G175900 Sobic005G175900 Sobic006G117100--Sobic005G175900 Sobic007G192000 Sobic007G192000 Sobic006G117100--Sobic007G192000 Sobic009G204900 Sobic009G204900 Sobic006G117100--Sobic009G204900 Sobic006G031100 Sobic006G031100 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Octagon: transcription factors


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