Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G315600.1
Synonym Sb01g030670, RLK
Functional annotation lectin-like receptor kinase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QM77
Pfam PF00069 PF00139
Panther DB PTHR27007 PTHR27007:SF26
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55550 : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g38960.1 : lectin-like receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048650 , Zm00025a018481 , Zm00025a006785 , Zm00025a035650 , Zm00025a033822 , Zm00025a004289 , Zm00025a008835 , Zm00025a008837
Brachypodium KQJ92865
Barley HORVU2Hr1G034370.5 , HORVU2Hr1G034370.4 , HORVU2Hr1G034370.6 , HORVU2Hr1G034370.1 , HORVU3Hr1G007120.5 , HORVU3Hr1G007120.4 , HORVU3Hr1G007120.3 , HORVU3Hr1G007120.2 , HORVU3Hr1G007120.1 , HORVU5Hr1G020530.1
Wheat TraesCS2B02G208900 , TraesCS3B02G046700 , TraesCS2A02G182400 , TraesCS1A02G184500 , TraesCS3A02G037200 , TraesCS2D02G190200 , TraesCS2D02G190200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G485200 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
2 Sobic.008G012800 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
3 Sobic.001G505900 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G370800 tentative name(PubMedID : 31536532)@nuclear transcription factor Y subunit, putative, expressed K08064: NFYA, nuclear transcription factor Y, alpha
5 Sobic.002G420400 - -
6 Sobic.002G097601 - -
7 Sobic.004G339900 expressed protein -
8 Sobic.004G071050 - -
9 Sobic.007G041200 cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.003G270200 dehydrin family protein, expressed -
11 Sobic.004G065800 - -
12 Sobic.001G425900 EDM2, putative, expressed -
13 Sobic.003G247100 aspartic proteinase oryzasin-1 precursor, putative, expressed K08245: phytepsin
14 Sobic.010G106601 - K09422: transcription factor MYB, plant
15 Sobic.001G375800 expressed protein -
16 Sobic.006G107900 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G152300 - -
18 Sobic.001G088600 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G111400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G092700 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed K13993: HSP20 family protein


Gene co-expression network
sample Sobic001G315600 Sobic001G315600 Sobic001G485200 Sobic001G485200 Sobic001G315600--Sobic001G485200 Sobic008G012800 Sobic008G012800 Sobic001G315600--Sobic008G012800 Sobic001G505900 Sobic001G505900 Sobic001G315600--Sobic001G505900 Sobic002G370800 Sobic002G370800 Sobic001G315600--Sobic002G370800 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic001G315600--Sobic002G420400 Sobic002G097601 Sobic002G097601 Sobic001G315600--Sobic002G097601 Sobic004G339900 Sobic004G339900 Sobic001G315600--Sobic004G339900 Sobic004G071050 Sobic004G071050 Sobic001G315600--Sobic004G071050 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic001G315600--Sobic007G041200 Sobic006G107900 Sobic006G107900 Sobic001G485200--Sobic006G107900 Sobic003G400400 Sobic003G400400 Sobic001G485200--Sobic003G400400 Sobic001G485200--Sobic004G071050 Sobic002G391100 Sobic002G391100 Sobic001G485200--Sobic002G391100 Sobic001G017500 Sobic001G017500 Sobic001G485200--Sobic001G017500 Sobic001G485200--Sobic004G339900 Sobic010G106601 Sobic010G106601 Sobic001G485200--Sobic010G106601 Sobic001G485200--Sobic002G420400 Sobic002G302300 Sobic002G302300 Sobic001G485200--Sobic002G302300 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic008G012800--Sobic002G059100 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic008G012800--Sobic001G297300 Sobic001G059800 Sobic001G059800 Sobic008G012800--Sobic001G059800 Sobic008G012800--Sobic001G505900 Sobic002G234100 Sobic002G234100 Sobic008G012800--Sobic002G234100 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic008G012800--Sobic007G209700 Sobic008G012800--Sobic001G315600 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic008G012800--Sobic007G064400 Sobic010G010600 Sobic010G010600 Sobic008G012800--Sobic010G010600 Sobic001G313100 Sobic001G313100 Sobic001G505900--Sobic001G313100 Sobic006G155300 Sobic006G155300 Sobic001G505900--Sobic006G155300 Sobic001G469300 Sobic001G469300 Sobic001G505900--Sobic001G469300 Sobic004G322500 Sobic004G322500 Sobic001G505900--Sobic004G322500 Sobic006G210500 Sobic006G210500 Sobic001G505900--Sobic006G210500 Sobic001G505900--Sobic008G012800 Sobic002G416300 Sobic002G416300 Sobic001G505900--Sobic002G416300 Sobic001G505900--Sobic007G064400 Sobic004G065850 Sobic004G065850 Sobic001G505900--Sobic004G065850 Sobic001G425900 Sobic001G425900 Sobic002G370800--Sobic001G425900 Sobic002G370800--Sobic001G485200 Sobic010G118200 Sobic010G118200 Sobic002G370800--Sobic010G118200 Sobic002G370800--Sobic004G339900 Sobic002G370800--Sobic004G071050 Sobic002G370800--Sobic007G041200 Sobic001G083900 Sobic001G083900 Sobic002G370800--Sobic001G083900 Sobic002G104300 Sobic002G104300 Sobic002G370800--Sobic002G104300 Sobic009G033500 Sobic009G033500 Sobic002G370800--Sobic009G033500 Sobic002G420400--Sobic004G339900 Sobic002G420400--Sobic004G071050 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic002G420400--Sobic005G036200 Sobic004G242200 Sobic004G242200 Sobic002G420400--Sobic004G242200 Sobic002G420400--Sobic001G485200 Sobic003G379900 Sobic003G379900 Sobic002G420400--Sobic003G379900 Sobic001G375800 Sobic001G375800 Sobic002G420400--Sobic001G375800 Sobic010G152000 Sobic010G152000 Sobic002G420400--Sobic010G152000 Sobic001G194100 Sobic001G194100 Sobic002G420400--Sobic001G194100 Sobic001G069100 Sobic001G069100 Sobic002G097601--Sobic001G069100 Sobic002G097601--Sobic007G041200 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic002G097601--Sobic001G261700 Sobic004G322550 Sobic004G322550 Sobic002G097601--Sobic004G322550 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic002G097601--Sobic005G176875 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic002G097601--Sobic010G084800 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic002G097601--Sobic010G047300 Sobic009G169050 Sobic009G169050 Sobic002G097601--Sobic009G169050 Sobic008G116100 Sobic008G116100 Sobic002G097601--Sobic008G116100 Sobic004G339900--Sobic002G420400 Sobic004G339900--Sobic004G071050 Sobic004G339900--Sobic001G485200 Sobic004G339900--Sobic001G194100 Sobic004G339900--Sobic010G152000 Sobic004G339900--Sobic007G041200 Sobic004G339900--Sobic008G116100 Sobic004G065800 Sobic004G065800 Sobic004G339900--Sobic004G065800 Sobic004G163700 Sobic004G163700 Sobic004G339900--Sobic004G163700 Sobic004G071050--Sobic001G485200 Sobic004G071050--Sobic010G106601 Sobic004G071050--Sobic002G420400 Sobic004G071050--Sobic004G339900 Sobic004G071050--Sobic009G033500 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic004G071050--Sobic009G253800 Sobic004G071050--Sobic004G065800 Sobic004G071050--Sobic006G107900 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic004G071050--Sobic007G091200 Sobic007G041200--Sobic008G116100 Sobic007G041200--Sobic009G033500 Sobic007G041200--Sobic010G084800 Sobic007G041200--Sobic010G047300 Sobic007G041200--Sobic002G097601 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic007G041200--Sobic006G186300 Sobic007G041200--Sobic007G091200 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic007G041200--Sobic008G109600 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic007G041200--Sobic010G060100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.