Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G470500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QPV8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G091800 seven in absentia protein family protein, expressed -
2 Sobic.006G220100 - -
3 Sobic.004G347833 - -
4 Sobic.010G262950 - -
5 Sobic.007G187500 - -
6 Sobic.007G173400 - -
7 Sobic.009G131550 - K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
8 Sobic.004G272000 - -
9 Sobic.006G139900 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G109650 - -
11 Sobic.002G240300 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase
12 Sobic.002G221000 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G321000 - -
14 Sobic.008G154500 expressed protein -
15 Sobic.001G084133 - -
16 Sobic.001G477500 - -
17 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
18 Sobic.002G219000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./late senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@plant viral response family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G347850 - -
20 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G470500 Sobic001G470500 Sobic003G091800 Sobic003G091800 Sobic001G470500--Sobic003G091800 Sobic006G220100 Sobic006G220100 Sobic001G470500--Sobic006G220100 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic001G470500--Sobic004G347833 Sobic010G262950 Sobic010G262950 Sobic001G470500--Sobic010G262950 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic001G470500--Sobic007G187500 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G470500--Sobic007G173400 Sobic009G131550 Sobic009G131550 Sobic001G470500--Sobic009G131550 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic001G470500--Sobic004G272000 Sobic006G139900 Sobic006G139900 Sobic001G470500--Sobic006G139900 Sobic003G091800--Sobic004G272000 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic003G091800--Sobic001G084133 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic003G091800--Sobic004G089801 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic003G091800--Sobic005G230900 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic003G091800--Sobic002G221000 Sobic003G091800--Sobic007G173400 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic003G091800--Sobic008G026500 Sobic003G091800--Sobic004G347833 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic003G091800--Sobic001G005100 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic006G220100--Sobic008G154500 Sobic006G220100--Sobic002G221000 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic006G220100--Sobic001G403900 Sobic006G220100--Sobic001G005100 Sobic006G220100--Sobic004G272000 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic006G220100--Sobic004G055400 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic006G220100--Sobic008G176266 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic006G220100--Sobic010G129900 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic006G220100--Sobic001G221750 Sobic004G347833--Sobic007G173400 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G347833--Sobic009G180900 Sobic004G347833--Sobic007G187500 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic004G347833--Sobic008G064200 Sobic004G347833--Sobic004G272000 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G347833--Sobic004G074400 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic004G347833--Sobic002G219100 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic004G347833--Sobic001G228500 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic004G347833--Sobic001G234766 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic010G262950--Sobic006G222200 Sobic010G262950--Sobic001G221750 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic010G262950--Sobic003G245000 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic010G262950--Sobic002G033100 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic010G262950--Sobic005G150250 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic010G262950--Sobic006G155400 Sobic010G262950--Sobic001G084133 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic010G262950--Sobic001G421450 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic010G262950--Sobic003G193900 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic007G187500--Sobic002G160300 Sobic007G187500--Sobic004G347833 Sobic007G187500--Sobic009G180900 Sobic007G187500--Sobic001G228500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic002G215600 Sobic007G187500--Sobic007G173400 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic007G187500--Sobic009G181000 Sobic007G187500--Sobic008G064200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic007G187500--Sobic010G210400 Sobic007G173400--Sobic004G347833 Sobic007G173400--Sobic001G234766 Sobic007G173400--Sobic004G272000 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic007G173400--Sobic010G160850 Sobic007G173400--Sobic001G228500 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic007G173400--Sobic001G208166 Sobic007G173400--Sobic008G064200 Sobic007G173400--Sobic007G187500 Sobic007G173400--Sobic004G089801 Sobic009G131550--Sobic001G208166 Sobic009G131550--Sobic001G228500 Sobic002G123750 Sobic002G123750 Sobic009G131550--Sobic002G123750 Sobic009G131550--Sobic007G173400 Sobic001G182100 Sobic001G182100 Sobic009G131550--Sobic001G182100 Sobic009G131550--Sobic006G139900 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic009G131550--Sobic002G043201 Sobic009G131550--Sobic007G187500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic009G131550--Sobic008G109650 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic008G176266 Sobic006G139900--Sobic010G210400 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic006G139900--Sobic010G000401 Sobic006G139900--Sobic001G005100 Sobic006G139900--Sobic002G365300 Sobic006G139900--Sobic007G187500 Sobic006G139900--Sobic004G089801 Sobic006G139900--Sobic006G220100 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic006G139900--Sobic004G045000 Sobic006G139900--Sobic004G347833
Octagon: transcription factors


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