Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G524300.1
Synonym Sb01g048830
Functional annotation diacylglycerol kinase, putative, expressed
UniProt C5X018
Pfam PF00781
Panther DB PTHR12358 PTHR12358:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016301; kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G46090 : Diacylglycerol kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g03400.1 : diacylglycerol kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000340 , Zm00025a053496
Brachypodium KQK23897
Barley HORVU4Hr1G083340.8 , HORVU4Hr1G083340.2 , HORVU4Hr1G083340.4 , HORVU4Hr1G083340.6 , HORVU4Hr1G083340.7 , HORVU4Hr1G083340.23 , HORVU4Hr1G083340.21 , HORVU4Hr1G083340.22 , HORVU4Hr1G083340.20 , HORVU4Hr1G083340.27 , HORVU4Hr1G083340.26 , HORVU4Hr1G083340.25 , HORVU4Hr1G083340.24 , HORVU4Hr1G083340.11 , HORVU4Hr1G083340.1 , HORVU4Hr1G083340.17 , HORVU4Hr1G083340.3 , HORVU4Hr1G083340.5 , HORVU4Hr1G083340.12 , HORVU4Hr1G083340.13 , HORVU4Hr1G083340.10 , HORVU4Hr1G083340.14 , HORVU4Hr1G083340.15 , HORVU4Hr1G083340.18 , HORVU4Hr1G083340.19
Wheat TraesCS4B02G318300 , TraesCS4B02G318300 , TraesCS4D02G314700 , TraesCS5A02G493900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G186600 dihydrodipicolinate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K01714: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
2 Sobic.009G193500 AGAP007115-PA, putative, expressed -
3 Sobic.002G131500 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G336000 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
5 Sobic.004G359100 expressed protein -
6 Sobic.005G149400 maf, putative, expressed K06287: septum formation protein
7 Sobic.005G117300 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.007G208300 peptidase, putative, expressed K14677: aminoacylase
9 Sobic.009G068300 chloroplast lumen common family protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G246500 OTU-like cysteine protease family protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G054400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -
12 Sobic.004G065300 CR084 protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G343900 expressed protein -
14 Sobic.003G085000 sufB/sufD domain containing protein, putative, expressed K09015: Fe-S cluster assembly protein SufD
15 Sobic.002G102200 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
16 Sobic.001G309300 expressed protein -
17 Sobic.002G431300 uncharacterized ACR, YagE family COG1723 containing protein, expressed -
18 Sobic.010G136200 oxidoreductase/ transition metal ion binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G085200 glyoxalase family protein, putative, expressed K01759: GLO1, lactoylglutathione lyase
20 Sobic.005G199400 glutathione synthetase, chloroplast precursor, putative, expressed K01920: glutathione synthase


Gene co-expression network
sample Sobic001G524300 Sobic001G524300 Sobic006G186600 Sobic006G186600 Sobic001G524300--Sobic006G186600 Sobic009G193500 Sobic009G193500 Sobic001G524300--Sobic009G193500 Sobic002G131500 Sobic002G131500 Sobic001G524300--Sobic002G131500 Sobic004G336000 Sobic004G336000 Sobic001G524300--Sobic004G336000 Sobic004G359100 Sobic004G359100 Sobic001G524300--Sobic004G359100 Sobic005G149400 Sobic005G149400 Sobic001G524300--Sobic005G149400 Sobic005G117300 Sobic005G117300 Sobic001G524300--Sobic005G117300 Sobic007G208300 Sobic007G208300 Sobic001G524300--Sobic007G208300 Sobic009G068300 Sobic009G068300 Sobic001G524300--Sobic009G068300 Sobic001G102500 Sobic001G102500 Sobic006G186600--Sobic001G102500 Sobic002G431300 Sobic002G431300 Sobic006G186600--Sobic002G431300 Sobic004G333400 Sobic004G333400 Sobic006G186600--Sobic004G333400 Sobic008G089500 Sobic008G089500 Sobic006G186600--Sobic008G089500 Sobic006G186600--Sobic009G193500 Sobic006G094300 Sobic006G094300 Sobic006G186600--Sobic006G094300 Sobic008G130900 Sobic008G130900 Sobic006G186600--Sobic008G130900 Sobic010G109600 Sobic010G109600 Sobic006G186600--Sobic010G109600 Sobic005G002900 Sobic005G002900 Sobic006G186600--Sobic005G002900 Sobic004G026500 Sobic004G026500 Sobic009G193500--Sobic004G026500 Sobic002G339300 Sobic002G339300 Sobic009G193500--Sobic002G339300 Sobic002G276100 Sobic002G276100 Sobic009G193500--Sobic002G276100 Sobic001G124100 Sobic001G124100 Sobic009G193500--Sobic001G124100 Sobic007G103100 Sobic007G103100 Sobic009G193500--Sobic007G103100 Sobic002G168500 Sobic002G168500 Sobic009G193500--Sobic002G168500 Sobic008G172300 Sobic008G172300 Sobic009G193500--Sobic008G172300 Sobic001G219700 Sobic001G219700 Sobic009G193500--Sobic001G219700 Sobic009G193500--Sobic006G186600 Sobic005G199400 Sobic005G199400 Sobic002G131500--Sobic005G199400 Sobic002G167500 Sobic002G167500 Sobic002G131500--Sobic002G167500 Sobic003G311900 Sobic003G311900 Sobic002G131500--Sobic003G311900 Sobic001G355800 Sobic001G355800 Sobic002G131500--Sobic001G355800 Sobic006G274800 Sobic006G274800 Sobic002G131500--Sobic006G274800 Sobic004G121300 Sobic004G121300 Sobic002G131500--Sobic004G121300 Sobic001G136800 Sobic001G136800 Sobic002G131500--Sobic001G136800 Sobic002G131500--Sobic004G026500 Sobic001G192000 Sobic001G192000 Sobic002G131500--Sobic001G192000 Sobic001G309300 Sobic001G309300 Sobic004G336000--Sobic001G309300 Sobic001G495200 Sobic001G495200 Sobic004G336000--Sobic001G495200 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic004G336000--Sobic008G073100 Sobic001G291900 Sobic001G291900 Sobic004G336000--Sobic001G291900 Sobic003G432500 Sobic003G432500 Sobic004G336000--Sobic003G432500 Sobic006G055800 Sobic006G055800 Sobic004G336000--Sobic006G055800 Sobic004G011300 Sobic004G011300 Sobic004G336000--Sobic004G011300 Sobic003G085000 Sobic003G085000 Sobic004G336000--Sobic003G085000 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic004G336000--Sobic003G387100 Sobic002G343400 Sobic002G343400 Sobic004G359100--Sobic002G343400 Sobic004G359100--Sobic002G431300 Sobic005G082200 Sobic005G082200 Sobic004G359100--Sobic005G082200 Sobic004G238900 Sobic004G238900 Sobic004G359100--Sobic004G238900 Sobic003G067100 Sobic003G067100 Sobic004G359100--Sobic003G067100 Sobic010G255100 Sobic010G255100 Sobic004G359100--Sobic010G255100 Sobic003G083400 Sobic003G083400 Sobic004G359100--Sobic003G083400 Sobic001G375000 Sobic001G375000 Sobic004G359100--Sobic001G375000 Sobic006G088000 Sobic006G088000 Sobic004G359100--Sobic006G088000 Sobic004G307400 Sobic004G307400 Sobic005G149400--Sobic004G307400 Sobic005G149400--Sobic004G336000 Sobic004G016400 Sobic004G016400 Sobic005G149400--Sobic004G016400 SobicK031800 SobicK031800 Sobic005G149400--SobicK031800 Sobic005G149400--Sobic003G387100 Sobic009G030800 Sobic009G030800 Sobic005G149400--Sobic009G030800 Sobic005G149400--Sobic001G309300 Sobic009G059300 Sobic009G059300 Sobic005G149400--Sobic009G059300 Sobic005G149400--Sobic008G073100 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic005G117300--Sobic004G003900 Sobic009G092900 Sobic009G092900 Sobic005G117300--Sobic009G092900 Sobic009G085200 Sobic009G085200 Sobic005G117300--Sobic009G085200 Sobic001G025800 Sobic001G025800 Sobic005G117300--Sobic001G025800 Sobic008G090900 Sobic008G090900 Sobic005G117300--Sobic008G090900 Sobic004G065300 Sobic004G065300 Sobic005G117300--Sobic004G065300 Sobic001G346600 Sobic001G346600 Sobic005G117300--Sobic001G346600 Sobic005G117300--Sobic001G495200 Sobic005G117300--Sobic007G208300 Sobic001G531400 Sobic001G531400 Sobic007G208300--Sobic001G531400 Sobic007G208300--Sobic001G291900 Sobic007G208300--Sobic003G085000 Sobic007G208300--Sobic004G336000 Sobic004G301200 Sobic004G301200 Sobic007G208300--Sobic004G301200 Sobic001G295300 Sobic001G295300 Sobic007G208300--Sobic001G295300 Sobic001G104800 Sobic001G104800 Sobic007G208300--Sobic001G104800 Sobic006G132000 Sobic006G132000 Sobic007G208300--Sobic006G132000 Sobic004G055500 Sobic004G055500 Sobic007G208300--Sobic004G055500 Sobic009G068300--Sobic005G002900 Sobic008G063200 Sobic008G063200 Sobic009G068300--Sobic008G063200 Sobic009G068300--Sobic003G085000 Sobic009G068300--Sobic010G255100 Sobic009G068300--Sobic001G291900 Sobic009G068300--Sobic004G333400 Sobic002G102200 Sobic002G102200 Sobic009G068300--Sobic002G102200 Sobic006G210400 Sobic006G210400 Sobic009G068300--Sobic006G210400 Sobic009G068300--Sobic004G336000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.