Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G005100.1
Synonym Sb02g000670
Functional annotation dirigent, putative, expressed
UniProt A0A1W0W1M7
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF53
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42510 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g28790.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044862 , Zm00025a044861
Brachypodium PNT60916
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110454 - -
2 Sobic.005G110451 - -
3 Sobic.002G010900 expressed protein -
4 Sobic.003G060000 Cupin domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G144800 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.001G114900 - -
7 Sobic.010G211600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@gp176, putative, expressed -
8 Sobic.005G048900 - -
9 Sobic.001G188800 cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.008G164201 - -
11 Sobic.001G195300 cytochrome P450, putative, expressed -
12 Sobic.008G158332 - -
13 Sobic.001G401000 pathogenesis-related Bet v I family protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G022000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
15 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
16 Sobic.005G101900 O-methyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.008G027600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G369400 Sulfotransferase family protein (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G158800 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.010G210100 "GW6(Ortholog in rice:Song et al., 2015)"(PubMedID : 31659936)@HLS, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G005100 Sobic002G005100 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G005100--Sobic005G110454 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G005100--Sobic005G110451 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic002G005100--Sobic002G010900 Sobic003G060000 Sobic003G060000 Sobic002G005100--Sobic003G060000 Sobic009G144800 Sobic009G144800 Sobic002G005100--Sobic009G144800 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G005100--Sobic001G114900 Sobic010G211600 Sobic010G211600 Sobic002G005100--Sobic010G211600 Sobic005G048900 Sobic005G048900 Sobic002G005100--Sobic005G048900 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic002G005100--Sobic001G188800 Sobic005G110454--Sobic005G110451 Sobic001G195300 Sobic001G195300 Sobic005G110454--Sobic001G195300 Sobic005G110454--Sobic002G010900 Sobic001G401000 Sobic001G401000 Sobic005G110454--Sobic001G401000 Sobic005G110454--Sobic001G114900 Sobic005G224000 Sobic005G224000 Sobic005G110454--Sobic005G224000 Sobic005G110454--Sobic009G144800 Sobic005G110454--Sobic010G211600 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic005G110454--Sobic008G158332 Sobic005G110451--Sobic005G110454 Sobic005G110451--Sobic001G195300 Sobic005G110451--Sobic002G010900 Sobic005G110451--Sobic001G401000 Sobic005G110451--Sobic001G114900 Sobic005G110451--Sobic005G224000 Sobic005G110451--Sobic010G211600 Sobic005G110451--Sobic009G144800 Sobic005G110451--Sobic008G158332 Sobic002G010900--Sobic001G114900 Sobic002G010900--Sobic005G110454 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic002G010900--Sobic002G422300 Sobic002G010900--Sobic005G110451 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic002G010900--Sobic008G022000 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic002G010900--Sobic006G101300 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic005G177600 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic008G158332 SobicK026900 SobicK026900 Sobic003G060000--SobicK026900 Sobic003G060000--Sobic001G114900 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic003G060000--Sobic008G027600 Sobic010G009900 Sobic010G009900 Sobic003G060000--Sobic010G009900 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic003G060000--Sobic010G158500 Sobic003G073460 Sobic003G073460 Sobic003G060000--Sobic003G073460 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic003G060000--Sobic005G066100 Sobic006G158400 Sobic006G158400 Sobic003G060000--Sobic006G158400 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic003G060000--Sobic004G202400 Sobic009G144900 Sobic009G144900 Sobic009G144800--Sobic009G144900 Sobic009G144800--Sobic005G177600 Sobic009G144800--Sobic001G114900 Sobic005G070200 Sobic005G070200 Sobic009G144800--Sobic005G070200 Sobic009G144800--Sobic002G010900 Sobic009G144800--Sobic008G022000 Sobic005G101900 Sobic005G101900 Sobic009G144800--Sobic005G101900 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic009G144800--Sobic002G369400 Sobic009G144800--Sobic005G110454 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic001G114900--Sobic003G026400 Sobic001G114900--Sobic008G027600 Sobic001G114900--Sobic002G010900 Sobic001G114900--Sobic002G369400 Sobic001G114900--Sobic008G022000 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic001G114900--Sobic006G008000 Sobic001G114900--Sobic002G422300 Sobic001G114900--Sobic008G158332 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic001G114900--Sobic008G066200 Sobic002G004900 Sobic002G004900 Sobic010G211600--Sobic002G004900 Sobic003G280200 Sobic003G280200 Sobic010G211600--Sobic003G280200 Sobic010G211600--Sobic008G027600 Sobic008G158100 Sobic008G158100 Sobic010G211600--Sobic008G158100 Sobic008G172600 Sobic008G172600 Sobic010G211600--Sobic008G172600 Sobic010G211600--Sobic005G177600 Sobic003G417700 Sobic003G417700 Sobic010G211600--Sobic003G417700 Sobic001G318500 Sobic001G318500 Sobic010G211600--Sobic001G318500 Sobic002G139300 Sobic002G139300 Sobic010G211600--Sobic002G139300 Sobic005G048900--Sobic002G005100 Sobic010G080800 Sobic010G080800 Sobic005G048900--Sobic010G080800 Sobic001G307800 Sobic001G307800 Sobic005G048900--Sobic001G307800 Sobic005G048900--Sobic003G060000 Sobic005G048900--Sobic005G066100 Sobic005G048900--Sobic010G158500 Sobic002G286566 Sobic002G286566 Sobic005G048900--Sobic002G286566 Sobic003G125332 Sobic003G125332 Sobic005G048900--Sobic003G125332 Sobic005G048900--SobicK026900 Sobic001G188800--Sobic006G008000 Sobic001G188800--Sobic008G066200 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic001G188800--Sobic005G086600 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic001G188800--Sobic003G079200 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic001G188800--Sobic002G012300 Sobic001G188800--Sobic008G022000 Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic001G188800--Sobic004G161751 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic001G188800--Sobic002G012500 Sobic001G188800--Sobic001G114900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.