Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G048900.1
Synonym Sb05g003990
Functional annotation -
UniProt C5Y585
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G005100 dirigent, putative, expressed -
2 Sobic.010G080800 zinc finger family protein, putative, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
3 Sobic.001G307800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G060000 Cupin domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G066100 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G158500 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G286566 - -
8 Sobic.003G125332 - K19347: SUN domain-containing protein 1/2
9 Sobic.K026900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.008G128200 - -
11 Sobic.010G211600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@gp176, putative, expressed -
12 Sobic.006G099100 - -
13 Sobic.004G240100 phosphoenolpyruvate carboxylase kinase, putative, expressed -
14 Sobic.007G204700 expressed protein -
15 Sobic.002G010900 expressed protein -
16 Sobic.010G210100 "GW6(Ortholog in rice:Song et al., 2015)"(PubMedID : 31659936)@HLS, putative, expressed -
17 Sobic.003G407001 - -
18 Sobic.006G158400 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed K15095: (+)-neomenthol dehydrogenase
19 Sobic.009G116600 C2 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G128066 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G048900 Sobic005G048900 Sobic002G005100 Sobic002G005100 Sobic005G048900--Sobic002G005100 Sobic010G080800 Sobic010G080800 Sobic005G048900--Sobic010G080800 Sobic001G307800 Sobic001G307800 Sobic005G048900--Sobic001G307800 Sobic003G060000 Sobic003G060000 Sobic005G048900--Sobic003G060000 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic005G048900--Sobic005G066100 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic005G048900--Sobic010G158500 Sobic002G286566 Sobic002G286566 Sobic005G048900--Sobic002G286566 Sobic003G125332 Sobic003G125332 Sobic005G048900--Sobic003G125332 SobicK026900 SobicK026900 Sobic005G048900--SobicK026900 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G005100--Sobic005G110454 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G005100--Sobic005G110451 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic002G005100--Sobic002G010900 Sobic002G005100--Sobic003G060000 Sobic009G144800 Sobic009G144800 Sobic002G005100--Sobic009G144800 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G005100--Sobic001G114900 Sobic010G211600 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Octagon: transcription factors


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