Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G307800.1
Synonym Sb01g030000
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5WTF7
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31852 PTHR31852:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22870 : Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g39970.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003269
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G119000 X8 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G307800 Sobic001G307800 Sobic001G316800 Sobic001G316800 Sobic001G307800--Sobic001G316800 Sobic010G080800 Sobic010G080800 Sobic001G307800--Sobic010G080800 Sobic004G170800 Sobic004G170800 Sobic001G307800--Sobic004G170800 Sobic002G280300 Sobic002G280300 Sobic001G307800--Sobic002G280300 Sobic010G106000 Sobic010G106000 Sobic001G307800--Sobic010G106000 Sobic005G142500 Sobic005G142500 Sobic001G307800--Sobic005G142500 Sobic001G531300 Sobic001G531300 Sobic001G307800--Sobic001G531300 Sobic005G048900 Sobic005G048900 Sobic001G307800--Sobic005G048900 Sobic001G522700 Sobic001G522700 Sobic001G307800--Sobic001G522700 Sobic001G316800--Sobic001G307800 Sobic001G316800--Sobic002G280300 Sobic001G316800--Sobic004G170800 Sobic007G225400 Sobic007G225400 Sobic001G316800--Sobic007G225400 Sobic001G316800--Sobic005G142500 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic001G316800--Sobic001G514300 Sobic001G264400 Sobic001G264400 Sobic001G316800--Sobic001G264400 Sobic008G099100 Sobic008G099100 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Octagon: transcription factors


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