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Transcriptome id Sobic.008G128200.1
Synonym
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UniProt A0A1B6PDD0
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KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G204700 expressed protein -
2 Sobic.008G128066 - -
3 Sobic.010G045500 AMP-binding enzyme, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
4 Sobic.003G364200 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
5 Sobic.006G078900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@tetraspanin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G127933 - -
7 Sobic.005G215400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@BBTI13 - Bowman-Birk type bran trypsin inhibitor precursor, expressed -
8 Sobic.005G069800 OsWAK124 - OsWAK receptor-like protein OsWAK-RLP, expressed -
9 Sobic.005G066100 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.002G105300 SCP-like extracellular protein, expressed -
11 Sobic.006G158400 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed K15095: (+)-neomenthol dehydrogenase
12 Sobic.003G430500 OsCML23 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
13 Sobic.010G270700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
14 Sobic.003G426600 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
15 Sobic.003G441500 RCLEA2 - Root cap and Late embryogenesis related family protein precursor, putative, expressed -
16 Sobic.001G242100 expressed protein -
17 Sobic.001G242000 CSLF7 - cellulose synthase-like family F@ beta1,3@1,4 glucan synthase, expressed -
18 Sobic.004G322800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
19 Sobic.008G022000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
20 Sobic.K026900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase


Gene co-expression network
sample Sobic008G128200 Sobic008G128200 Sobic007G204700 Sobic007G204700 Sobic008G128200--Sobic007G204700 Sobic008G128066 Sobic008G128066 Sobic008G128200--Sobic008G128066 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic008G128200--Sobic010G045500 Sobic003G364200 Sobic003G364200 Sobic008G128200--Sobic003G364200 Sobic006G078900 Sobic006G078900 Sobic008G128200--Sobic006G078900 Sobic008G127933 Sobic008G127933 Sobic008G128200--Sobic008G127933 Sobic005G215400 Sobic005G215400 Sobic008G128200--Sobic005G215400 Sobic005G069800 Sobic005G069800 Sobic008G128200--Sobic005G069800 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic008G128200--Sobic005G066100 Sobic006G158400 Sobic006G158400 Sobic007G204700--Sobic006G158400 Sobic001G462700 Sobic001G462700 Sobic007G204700--Sobic001G462700 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic007G204700--Sobic010G158500 Sobic007G204700--Sobic008G127933 Sobic001G237900 Sobic001G237900 Sobic007G204700--Sobic001G237900 Sobic007G204700--Sobic005G215400 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic007G204700--Sobic004G202400 Sobic007G204700--Sobic008G128200 Sobic004G348800 Sobic004G348800 Sobic007G204700--Sobic004G348800 Sobic008G128066--Sobic008G127933 Sobic008G128066--Sobic007G204700 Sobic008G128066--Sobic008G128200 Sobic008G128066--Sobic006G078900 Sobic008G128066--Sobic003G364200 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic008G128066--Sobic002G093700 Sobic008G128066--Sobic005G066100 Sobic002G425000 Sobic002G425000 Sobic008G128066--Sobic002G425000 Sobic008G128066--Sobic001G237900 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic010G045500--Sobic001G242100 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic010G045500--Sobic002G301900 Sobic006G234466 Sobic006G234466 Sobic010G045500--Sobic006G234466 Sobic004G180700 Sobic004G180700 Sobic010G045500--Sobic004G180700 Sobic010G045500--Sobic005G215400 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic010G045500--Sobic004G322800 Sobic010G270700 Sobic010G270700 Sobic010G045500--Sobic010G270700 Sobic004G301600 Sobic004G301600 Sobic010G045500--Sobic004G301600 Sobic010G045500--Sobic008G128200 Sobic003G364200--Sobic008G128066 Sobic003G364200--Sobic008G128200 Sobic003G364200--Sobic007G204700 Sobic003G364200--Sobic005G215400 Sobic003G364200--Sobic010G045500 Sobic003G364200--Sobic004G322800 Sobic003G364200--Sobic008G127933 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic003G364200--Sobic005G160700 Sobic006G122800 Sobic006G122800 Sobic003G364200--Sobic006G122800 Sobic006G078900--Sobic007G204700 Sobic006G078900--Sobic008G128066 Sobic006G078900--Sobic008G128200 Sobic002G090900 Sobic002G090900 Sobic006G078900--Sobic002G090900 Sobic006G078900--Sobic010G158500 Sobic006G078900--Sobic002G093700 Sobic002G105300 Sobic002G105300 Sobic006G078900--Sobic002G105300 Sobic002G124500 Sobic002G124500 Sobic006G078900--Sobic002G124500 Sobic006G078900--Sobic003G364200 Sobic008G127933--Sobic006G158400 Sobic008G127933--Sobic002G425000 Sobic008G127933--Sobic001G237900 Sobic008G127933--Sobic007G204700 Sobic008G127933--Sobic008G128066 Sobic008G127933--Sobic010G270700 Sobic008G009400 Sobic008G009400 Sobic008G127933--Sobic008G009400 Sobic001G238400 Sobic001G238400 Sobic008G127933--Sobic001G238400 SobicK026900 SobicK026900 Sobic008G127933--SobicK026900 Sobic005G215400--Sobic004G348800 Sobic005G215400--Sobic007G204700 Sobic005G215400--Sobic010G045500 Sobic001G430100 Sobic001G430100 Sobic005G215400--Sobic001G430100 Sobic010G212500 Sobic010G212500 Sobic005G215400--Sobic010G212500 Sobic005G215400--Sobic002G105300 Sobic003G119500 Sobic003G119500 Sobic005G215400--Sobic003G119500 Sobic007G050200 Sobic007G050200 Sobic005G215400--Sobic007G050200 Sobic005G215400--Sobic004G322800 Sobic005G070200 Sobic005G070200 Sobic005G069800--Sobic005G070200 Sobic005G069700 Sobic005G069700 Sobic005G069800--Sobic005G069700 Sobic004G022900 Sobic004G022900 Sobic005G069800--Sobic004G022900 Sobic005G069800--Sobic008G128200 Sobic009G144800 Sobic009G144800 Sobic005G069800--Sobic009G144800 Sobic007G002700 Sobic007G002700 Sobic005G069800--Sobic007G002700 Sobic001G487600 Sobic001G487600 Sobic005G069800--Sobic001G487600 Sobic003G441500 Sobic003G441500 Sobic005G069800--Sobic003G441500 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic005G069800--Sobic005G177600 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic005G066100--Sobic005G066432 Sobic005G066100--Sobic004G202400 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic005G066100--Sobic005G065900 Sobic005G066100--SobicK026900 Sobic005G066100--Sobic007G204700 Sobic005G066100--Sobic002G425000 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic005G066100--Sobic010G148800 Sobic005G066100--Sobic008G127933 Sobic005G066100--Sobic010G158500
Octagon: transcription factors


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