Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G023600.1,Sobic.002G023600.2
Synonym
Functional annotation BED zinc finger family protein, expressed
UniProt A0A1B6Q8T9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g21410.1 : BED zinc finger family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
2 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
3 Sobic.002G059800 - -
4 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
6 Sobic.002G105000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G182000 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
8 Sobic.002G344301 - -
9 Sobic.002G316500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G431200 - -
11 Sobic.004G200866 - -
12 Sobic.001G271000 - -
13 Sobic.004G089500 - -
14 Sobic.007G005000 expressed protein -
15 Sobic.007G198800 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G058800 expressed protein -
18 Sobic.002G182300 - -
19 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G023600 Sobic002G023600 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic002G023600--Sobic007G199300 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic002G023600--Sobic005G127300 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic002G023600--Sobic002G059800 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic002G023600--Sobic004G204400 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic002G023600--Sobic001G355400 Sobic002G105000 Sobic002G105000 Sobic002G023600--Sobic002G105000 Sobic001G182000 Sobic001G182000 Sobic002G023600--Sobic001G182000 Sobic002G344301 Sobic002G344301 Sobic002G023600--Sobic002G344301 Sobic002G316500 Sobic002G316500 Sobic002G023600--Sobic002G316500 Sobic007G199300--Sobic005G127300 Sobic007G199300--Sobic002G059800 Sobic002G108200 Sobic002G108200 Sobic007G199300--Sobic002G108200 Sobic007G199300--Sobic004G204400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic007G199300--Sobic008G106400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic007G199300--Sobic005G221550 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic007G199300--Sobic002G431200 Sobic009G121750 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Octagon: transcription factors


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